一株新铜绿假单胞菌噬菌体S R T6的分离以及全基因组序列分析

• 作者: 伊廷旭 刘子辰 张春龙 张福康 李骑 樊祥宇 马鸿芮 高晓萌
• 来源期刊: 聊城大学学报（自然科学版）
• 学科: 生物学
• 关键词: 铜绿假单胞菌 铜绿假单胞菌噬菌体 SRT6 全基因组测序 比较基因组学分析
• 年，卷（期）: 2018,（3）
• 所属期刊栏目: 基础科学研究
• 页码范围: 67-78
• 页数: 12页
• 分类号: Q939
• 字数: 6600字
• 语种: 中文
• DOI: 10.19728/j.issn1672-6634.2018.03.011

摘要

分离一株新铜绿假单胞菌噬菌体,进行生物学特征分析,全基因组测序和比较基因组学分析.了解该噬菌体与其他假单胞菌噬菌体之间的亲缘关系以及它的潜在应用价值.利用双层平板法分离纯化噬菌体,利用酚氯仿抽提基因组,利用Illumina Hiseq测序平台对基因组测序,利用生物信息学进行基因组和比较基因组学分析.分离到一株新的烈性铜绿假单胞菌噬菌体SRT6,其基因组全长91364 bp,G+C含量49.3％,存在182个蛋白质编码基因,其中的96个与已知功能的蛋白质具有相似性,无tRNA和tmRNA.比较基因组分析发现,噬菌体SRT6属于一个新物种.分离鉴定出一株烈性铜绿假单胞菌噬菌体SRT6,并发现它属于一个新种噬菌体,为未来利用噬菌体治疗耐药铜绿假单胞菌感染打下坚实的基础.