基于ACC变换和RFE算法的蛋白质亚核定位预测

• 作者: 刘太岗 李小苇 王春华 陶珮莹
• 来源期刊: 计算机工程与应用
• 学科: 工学
• 关键词: 蛋白质亚核定位 位置特异性得分矩阵 自互协方差变换 递归特征消除
• 年，卷（期）: 2016,（15）
• 所属期刊栏目: 大数据与云计算
• 页码范围: 83-87
• 页数: 5页
• 分类号: TP181|Q51
• 字数: 4206字
• 语种: 中文
• DOI: 10.3778/j.issn.1002-8331.1410-0219

摘要

获取真核细胞中细胞核内蛋白质定位的信息对注解蛋白质功能具有非常重要的意义。针对于利用计算方法预测蛋白质在亚核水平上的定位更具挑战性的问题，提出了基于自互协方差变换与递归特征消除预测蛋白质亚核定位的方法。该方法基于位置特异性得分矩阵利用自互协方差变换构建蛋白质序列的特征向量，采用递归特征消除法进行特征选择，选用支持向量机作为预测工具，并在两个经典数据集SC714和LD504上进行了夹克刀测试。实验结果表明，该方法比大多数已报道的预测方法具有更高的预测准确率。

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	刘太岗	上海海洋大学信息学院	7	10	2.0	3.0
2	王春华	上海海洋大学信息学院	14	23	3.0	4.0
3	李小苇	上海海洋大学食品学院	1	1	1.0	1.0
4	陶珮莹	上海海洋大学食品学院	1	1	1.0	1.0