甘蓝型油菜紫色酸性磷酸酶基因类似物的生物信息学分析

• 作者: 曹刚强 杨冬之 焦思凯 臧新 邹春阳
• 来源期刊: 北方园艺
• 学科: 农学
• 关键词: 甘蓝型油菜 紫色酸性磷酸酶(PAP)基因 生物信息学分析 功能预测
• 年，卷（期）: 2016,（13）
• 所属期刊栏目: 生物技术
• 页码范围: 93-97
• 分类号: S634.303.6
• 语种: 中文
• DOI: 10.11937/bfyy.201613025

摘要

利用生物信息网络数据库,对甘蓝型油菜紫色酸性磷酸酶基因(PAP)类似物编码的蛋白进行生物信息学分析,以预测该蛋白的理化性质、分子结构与生物学功能.结果表明:该基因编码的蛋白含481个氨基酸,其蛋白的分子式为C2520 H3714 N66O719S19,分子量为55.45 kDa,等电点为6.35,为亲水性分泌型蛋白,并且不稳定;存在3个跨膜螺旋区域及3个卷曲螺旋结构,含有1个信号肽、39个潜在磷酸化位点和3个N-糖基化修饰,存在6种类型特定的功能位点,主要定位于高尔基体;氨基酸序列同源性分析表明,该基因编码的蛋白与甘蓝型油菜PAP12家族具有较近的亲缘关系,直系同源于甘蓝型油菜PAP12-5;二级结构主要为无规则卷曲、延伸链和α-螺旋,具有较为明显的10个螺旋和26个折叠;具有PAP的保守结构域,属于金属磷酸二酯酶超家族成员;根据保守结构域及功能位点分析发现该基因属于紫色酸性磷酸酶类,可能属于甘蓝型油菜PAP基因家族成员,预测其编码产物在植物磷高效利用与吸收中发挥重要的生理功能.生物信息学分析及结合蛋白的结构与功能预测分析可为深入研究甘蓝型油菜PAP提供理论指导.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	曹刚强	郑州大学生命科学学院	48	530	10.0	22.0
2	臧新	郑州大学生命科学学院	35	198	8.0	13.0
3	杨冬之	郑州大学生命科学学院	23	153	8.0	11.0
4	邹春阳	郑州大学生命科学学院	1	0	0.0	0.0
5	焦思凯	郑州大学生命科学学院	1	0	0.0	0.0