转录组测序分析吲哚美辛对小鼠小肠类器官的影响

• 作者: 冉志华 宋东娟 沈骏 童锦禄 蔡晨雯 赵笛 郑青
• 来源期刊: 中华炎性肠病杂志（中英文）
• 关键词: 吲哚美辛 小肠类器官 高通量测序
• 年，卷（期）: 2017,（3）
• 所属期刊栏目: 论著
• 页码范围: 171-176
• 页数: 6页
• 字数: 4687字
• 语种: 中文
• DOI: 10.3760/cma.j.issn.2096-367X.2017.03.012

摘要

目的 探讨吲哚美辛对小鼠小肠类器官转录组的影响.方法 采用四唑盐比色法检测吲哚美辛对小肠类器官存活率的影响,Illumina Hiseq测序技术筛选吲哚美辛组与对照组小肠类器官之间的差异表达基因,并对差异表达基因进行基因本体(GO)、京都基因与基因组百科全书(KEGG)功能注释与富集分析.结果 四唑盐比色法检测结果显示100,250,300,400,500 μM吲哚美辛作用于小鼠小肠类器官48 h后的存活率分别为80.34％,70.17％,61.94％,54.38％,42.22％.250 μM吲哚美辛作用于小鼠小肠类器官24h、48 h、72 h后的存活率分别为80.56％,70.17％,59.30％.GO富集分析发现在细胞组分分类上,差异表达基因主要富集在微体与过氧化物酶体(P＜0.01),在分子功能组上,氧化还原活性、谷胱甘肽转移酶、羧酸结合是显著富集的类型(P＜0.01),有机酸代谢过程、含氧酸代谢过程与羧酸代谢过程是显著富集的GO生物过程(P＜0.01).KEGG富集分析发现差异表达基因显著富集在化学致癌作用、异源物质细胞色素P450代谢、细胞色素P450药物代谢、PPAR信号通路(P＜0.01).结论 吲哚美辛以时间与浓度依赖性方式抑制小鼠小肠类器官的增殖.小肠类器官可能存在抗氧化应激作用抵御吲哚美辛引起的小肠损伤.逆转氧化应激有望成为非甾体抗炎药小肠损伤的治疗靶点.