百日草属EST-SSR信息分析及其雄性不育两用系鉴别引物筛选

• 作者: 叶要妹 李娟 秦美姣 胡妙
• 来源期刊: 江西农业大学学报
• 学科: 农学
• 关键词: 百日草 雄性不育两用系 EST-SSR PCR反应体系 引物筛选
• 年，卷（期）: 2017,（5）
• 所属期刊栏目: 生物技术与工程
• 页码范围: 976-982
• 页数: 7页
• 分类号: S681.9
• 字数: 4408字
• 语种: 中文
• DOI: 10.13836/j.jjau.2017125

摘要

百日草雄性不育在F1代杂交育种中应用广泛,建立百日草雄性育性EST-SSR分子标记,为百日草分子标记辅助育种奠定科学基础.本研究通过分析NCBI数据库中百日草属EST序列20667条,进行EST-SSR信息的分析.采用20μL红酶PCR反应体系,以百日草雄性不育两用系MJ16AB的DNA为模板,筛选引物.结果获得622条重复基元不少于5次且重复序列长度≥12 bp的SSR,其中二、三核苷酸出现次数最多的是AT/TA、CTA/GAT,分别占总数的9.5%、10.6%.随机合成的136对引物中,引物28、30、33、69和ZeM63在百日草可育和不育两池间扩增出清晰且稳定的差异性条带.本试验验证了基于百日草属EST数据开发SSR分子标记的可行性,筛选出的5对多态性引物可用于建立百日草雄性育性分子标记.