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摘要:
前期通过转录组结合表达谱分析发现一类MBD片段在低温解除牡丹花芽内休眠中的差异表达,为了进一步研究MBD基因特征及其在牡丹休眠解除中的作用,利用RACE扩增获得1 204 bp PsMBD5全长cDNA,其中编码框1 056 bp,推测编码351个氨基酸.生物信息学分析结果显示,PsMBD5蛋白分子量约为38.127 4 kDa,等电点为5.14,不稳定系数为44.27,推测该蛋白为不稳定蛋白.同源性分析表明,牡丹PsMBD5与梅PmMBD5的同源性最高,为38.1%,与亚麻荠CsMBD5的同源性最低,为25.8%,与13种拟南芥MBD蛋白同源性最高的是AtMBD5.实时荧光定量PCR分析表明,PsMBD5基因在牡丹不同组织中均有表达,在初花期牡丹的根中转录水平最高,在花瓣、心皮和萼片中次之,在雄蕊中最低;PsMBD5基因在牡丹花芽中受低温诱导,且转录水平在低温处理14 d时达到最大值,之后维持较高的转录水平.研究结果为进一步解析PsMBD5基因对牡丹花芽的休眠解除的调控机制奠定基础.
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文献信息
篇名 牡丹DNA甲基结合域蛋白基因PsMBD5的克隆和表达特性分析
来源期刊 华北农学报 学科 农学
关键词 PsMBD RACE 生物信息学分析 表达特性
年,卷(期) 2017,(2) 所属期刊栏目
研究方向 页码范围 66-70
页数 5页 分类号 Q78|S685.03
字数 2998字 语种 中文
DOI 10.7668/hbnxb.2017.02.011
五维指标
作者信息
序号 姓名 单位 发文数 被引次数 H指数 G指数
1 盖伟玲 青岛农业大学农学与植保学院 17 294 9.0 17.0
2 刘春英 青岛农业大学生命科学学院山东省高校植物生物技术重点实验室 24 163 5.0 12.0
3 张玉喜 青岛农业大学生命科学学院山东省高校植物生物技术重点实验室 26 195 7.0 13.0
4 战新梅 青岛农业大学生命科学学院山东省高校植物生物技术重点实验室 6 11 2.0 3.0
5 司福会 青岛农业大学生命科学学院山东省高校植物生物技术重点实验室 1 2 1.0 1.0
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研究主题发展历程
节点文献
PsMBD
RACE
生物信息学分析
表达特性
研究起点
研究来源
研究分支
研究去脉
引文网络交叉学科
相关学者/机构
期刊影响力
华北农学报
双月刊
1000-7091
13-1101/S
大16开
石家庄市和平西路598号
18-10
1986
chi
出版文献量(篇)
6276
总下载数(次)
4
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