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牡丹DNA甲基结合域蛋白基因PsMBD5的克隆和表达特性分析
牡丹DNA甲基结合域蛋白基因PsMBD5的克隆和表达特性分析
作者:
刘春英
司福会
张玉喜
战新梅
盖伟玲
盖树鹏
基本信息来源于合作网站,原文需代理用户跳转至来源网站获取
PsMBD
RACE
生物信息学分析
表达特性
摘要:
前期通过转录组结合表达谱分析发现一类MBD片段在低温解除牡丹花芽内休眠中的差异表达,为了进一步研究MBD基因特征及其在牡丹休眠解除中的作用,利用RACE扩增获得1 204 bp PsMBD5全长cDNA,其中编码框1 056 bp,推测编码351个氨基酸.生物信息学分析结果显示,PsMBD5蛋白分子量约为38.127 4 kDa,等电点为5.14,不稳定系数为44.27,推测该蛋白为不稳定蛋白.同源性分析表明,牡丹PsMBD5与梅PmMBD5的同源性最高,为38.1%,与亚麻荠CsMBD5的同源性最低,为25.8%,与13种拟南芥MBD蛋白同源性最高的是AtMBD5.实时荧光定量PCR分析表明,PsMBD5基因在牡丹不同组织中均有表达,在初花期牡丹的根中转录水平最高,在花瓣、心皮和萼片中次之,在雄蕊中最低;PsMBD5基因在牡丹花芽中受低温诱导,且转录水平在低温处理14 d时达到最大值,之后维持较高的转录水平.研究结果为进一步解析PsMBD5基因对牡丹花芽的休眠解除的调控机制奠定基础.
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文献信息
篇名
牡丹DNA甲基结合域蛋白基因PsMBD5的克隆和表达特性分析
来源期刊
华北农学报
学科
农学
关键词
PsMBD
RACE
生物信息学分析
表达特性
年,卷(期)
2017,(2)
所属期刊栏目
研究方向
页码范围
66-70
页数
5页
分类号
Q78|S685.03
字数
2998字
语种
中文
DOI
10.7668/hbnxb.2017.02.011
五维指标
作者信息
序号
姓名
单位
发文数
被引次数
H指数
G指数
1
盖伟玲
青岛农业大学农学与植保学院
17
294
9.0
17.0
2
刘春英
青岛农业大学生命科学学院山东省高校植物生物技术重点实验室
24
163
5.0
12.0
3
张玉喜
青岛农业大学生命科学学院山东省高校植物生物技术重点实验室
26
195
7.0
13.0
4
战新梅
青岛农业大学生命科学学院山东省高校植物生物技术重点实验室
6
11
2.0
3.0
5
司福会
青岛农业大学生命科学学院山东省高校植物生物技术重点实验室
1
2
1.0
1.0
传播情况
被引次数趋势
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(/年)
引文网络
引文网络
二级参考文献
(88)
共引文献
(29)
参考文献
(21)
节点文献
引证文献
(2)
同被引文献
(3)
二级引证文献
(0)
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参考文献(0)
二级参考文献(1)
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参考文献(0)
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RACE
生物信息学分析
表达特性
研究起点
研究来源
研究分支
研究去脉
引文网络交叉学科
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华北农学报
主办单位:
河北
北京
天津
山西
河南
内蒙古六省市农科院农学会
出版周期:
双月刊
ISSN:
1000-7091
CN:
13-1101/S
开本:
大16开
出版地:
石家庄市和平西路598号
邮发代号:
18-10
创刊时间:
1986
语种:
chi
出版文献量(篇)
6276
总下载数(次)
4
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华北农学报2017年第2期
华北农学报2017年第1期
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