小麦黄花叶病毒(WYMV)2个山东分离物的全基因组序列及进化分析

• 作者: 于成明 原雪峰 师科荣 李向东 王德亚 田延平 耿国伟 顾珂
• 来源期刊: 植物病理学报
• 学科: 农学
• 关键词: 小麦黄花叶病毒 系统发生树 RNA重组
• 年，卷（期）: 2017,（3）
• 所属期刊栏目: 细胞生物学、生理学、生物化学、分子生物学
• 页码范围: 348-356
• 页数: 9页
• 分类号: S432.41
• 语种: 中文
• DOI: 10.13926/j.cnki.apps.000104

摘要

利用5'RACE结合一步法RT-PCR分别从山东泰安与临沂冬小麦上克隆了小麦黄花叶病毒(Wheat yellow mosaic virus,WYMV)的全基因组序列.这2个分离物(TADWK和LYJN)基因组间核苷酸一致性分别为97.21％ (RNA1)和95.12％(RNA2).通过对目前已报道的共14个分离物的基因组不同部分的分析,表明5'UTR是WYMV基因组变化幅度最大的区域,而编码区(ORF)及3'UTR的序列一致性较高且变动幅度小.另外,发现LYJN RNA2的5'UTR与已报道的所有分离物RNA2的核苷酸一致率仅为90％左右.综合分析RNA1和RNA2的系统发生树,表明WYMV各基因组片段呈单独进化特征,不同分离物间存在RNA重排.RNA重组分析显示在LYJN RNA1和TADWK RNA2发现了RNA重组.此研究说明WYMV在山东地区存在分离物分化现象,WYMV的5'UTR是基因组中的突变热点.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	李向东		124	1944	23.0	41.0
2	顾珂		3	2	1.0	1.0
3	于成明		7	7	1.0	2.0
4	师科荣		13	12	2.0	3.0
5	原雪峰		7	0	0.0	0.0
6	田延平		14	41	3.0	6.0
7	王德亚		4	0	0.0	0.0
8	耿国伟		4	0	0.0	0.0