利用高通量测序分析侵染贵州火龙果的病毒

• 作者: 彭志军 王壮 蔡永强 郑乾明 马玉华
• 来源期刊: 植物病理学报
• 学科: 农学
• 关键词: 仙人掌科 基因组 核苷酸 序列一致性
• 年，卷（期）: 2017,（3）
• 所属期刊栏目: 细胞生物学、生理学、生物化学、分子生物学
• 页码范围: 364-369
• 页数: 6页
• 分类号: S436.67|S432.41
• 语种: 中文
• DOI: 10.13926/j.cnki.apps.000101

摘要

对疑似感染病毒的火龙果(Hylocereus undatus Britt.)进行高通量测序,分析病毒种类和相对含量,为火龙果病毒诊断和检测提供理论基础.测序reads经拼接和注释,共3 969条contig注释为病毒,包含44354 147条reads.10条contig注释为CVX-NTU (JF937699),其含有的reads占所有病毒reads数量的85.18％;10条contig注释为ZyVX(AY366208),占所有病毒reads数量的4.97％;6条contig注释为SchVX(AY366207),占所有病毒reads数量的3.75％;6条contig注释为CVX(AF308158),占所有病毒reads数量的0.26％.拼接获得的CVX-NTU序列完全覆盖CVX-NTU (JF937699)基因组,核苷酸序列一致性为97％.编码的5个ORF核苷酸序列与CVX-NTU (JF937699)一致性为97％～98％,氨基酸序列一致性为97％～99％.拼接获得的CVX-NTU序列与CVX、ZyVX和SchVX的核苷酸序列一致性分别为78％、75％和70％.这是首次利用高通量测序检测火龙果病毒的报道.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	蔡永强		5	0	0.0	0.0
2	马玉华		2	0	0.0	0.0
3	彭志军		2	0	0.0	0.0
4	郑乾明		1	0	0.0	0.0
5	王壮		1	0	0.0	0.0