基于miRNA-TF调控网络识别乳腺癌亚型关键调控子

• 作者: 严自创 刘永晶 周元帅 张强 张瑞 许艳 赵宁 韩晓乐
• 来源期刊: 哈尔滨医科大学学报
• 学科: 医学
• 关键词: 乳腺癌亚型 miRNA-TF调控网络 miRNA
• 年，卷（期）: 2017,（1）
• 所属期刊栏目: 基础研究
• 页码范围: 21-24
• 页数: 4页
• 分类号: R737.9
• 字数: 3108字
• 语种: 中文

摘要

目的 挖掘乳腺癌各亚型关键调控子并评估其预后能力.方法 整合TCGA数据库中乳腺癌样本基因表达、拷贝数变异和DNA甲基化数据,分亚型筛选癌症相关基因.以此为基础,挖掘各亚型的四类motif,将同亚型四类motif合并构建各亚型miRNA-TF调控网络.随后,挖掘每个网络hub节点,并对其预后能力进行评估.结果 各调控网络中的10个hub miRNA分别为乳腺癌亚型关键调控子.结论 基于miRNA-TF调控网络能有效识别出乳腺癌亚型预后相关生物标志物.