基于生物信息学的乳腺癌miRNA生物标志物的筛选

• 作者: 周漩 李占潮
• 来源期刊: 广东药学院学报
• 学科: 医学
• 关键词: 乳腺癌 miRNA 生物标志物
• 年，卷（期）: 2017,（3）
• 所属期刊栏目: 药学研究
• 页码范围: 412-414,419
• 页数: 4页
• 分类号: R737.9
• 字数: 1951字
• 语种: 中文
• DOI: 10.16809/j.cnki.1006-8783.2016120801

摘要

目的 筛选与乳腺癌相关的miRNA生物标志物,为乳腺癌的早期诊断、预后评估以及药物靶点的研究提供参考.方法 从TCGA数据库中收集乳腺癌相关基因芯片数据,将肿瘤组织与正常组织样本数据进行对比分析,筛选差异miRNA与mRNA;预测差异miRNA的潜在靶基因并与差异mRNA取交集,进一步对miRNA进行筛选;采用ROC曲线分析对筛选得到的miRNA进行评价.结果 筛选得到9个差异miRNA,对肿瘤样本和正常样本分类良好.分别为6个上调miRNA:hsa-miR-141、hsa-miR-182、hsa-miR-183、hsa-miR-200a、hsa-miR-200b、hsa-miR-21;3个下调miRNA:hsa-let-7c、hsa-miR-125b-1、hsa-miR-145.结论 筛选得到的差异miRNA可作为乳腺癌的生物标志物,可对乳腺癌的发生进行预测.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	周漩	广东药科大学药学院	5	7	2.0	2.0
2	李占潮	广东药科大学药学院	3	5	1.0	2.0