猪流行性腹泻病毒陕西渭南株的遗传变异

• 作者: 吴萌萌 周宏超 张彦明 许夏澎 郭抗抗
• 来源期刊: 西北农业学报
• 学科: 农学
• 关键词: 猪流行性腹泻病毒 基因克隆 序列分析 遗传变异
• 年，卷（期）: 2017,（9）
• 所属期刊栏目: 研究报告
• 页码范围: 1273-1280
• 页数: 8页
• 分类号: S852.65+9.6
• 字数: 4624字
• 语种: 中文
• DOI: 10.7606/j.issn.1004-1389.2017.09.002

摘要

从陕西省渭南某规模化猪场采集疑似猪流行性腹泻(PED)仔猪病料进行病毒检测,旨在从基因遗传变异方面分析疾病发生的可能原因.通过RT-PCR从疑似仔猪20份小肠样品中检测到9份PED病毒阳性样品,并扩增出PED病毒M、ORF3和S基因的部分序列.序列分析结果表明,与CV777疫苗株对比,样品渭南(WN)株PEDV M基因高度保守,同源性为98.2％;ORF3基因存在11处碱基突变,同源性为98.2％;S基因突变较大,存在4个插入区域,分别是164～166、177～179、181～186和416～418 nt,内分核心中和表位区(COE,499～638位氨基酸)存在9个氨基酸突变位点.遗传分析显示,WN株M基因与中国近期分离毒株亲缘关系较近;ORF3基因与同处在G1群中的中国毒株亲缘关系较近,而与CV777疫苗株亲缘关系较远;S基因与中国早期分离毒株及CV777疫苗株亲缘性较远,与当前的流行株亲缘关系密切.这些结果表明,WN株与CV777疫苗株相比,有明显的遗传变异倾向,可能导致目前PEDV疫苗免疫效果下降,PED疫情大规模流行.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	张彦明	西北农林科技大学动物医学院	256	1530	16.0	24.0
2	周宏超	西北农林科技大学动物医学院	55	299	11.0	14.0
3	郭抗抗	西北农林科技大学动物医学院	109	484	12.0	16.0
4	吴萌萌	西北农林科技大学动物医学院	1	1	1.0	1.0
5	许夏澎	西北农林科技大学动物医学院	1	1	1.0	1.0