基于线粒体D-loop区四个鸡种DNA条形码和品种鉴定

• 作者: 唐修君 唐梦君 张小燕 樊艳风 贾晓旭 陆俊贤 陈大伟 韩威 高玉时
• 来源期刊: 农业生物技术学报
• 学科: 农学
• 关键词: 鸡 线粒体D-loop区 遗传多样性 DNA条形码 品种鉴定
• 年，卷（期）: 2017,（10）
• 所属期刊栏目: 研究论文与报告
• 页码范围: 1653-1660
• 页数: 8页
• 分类号: S831.2
• 字数: 4827字
• 语种: 中文
• DOI: 10.3969/j.issn.1674-7968.2017.10.011

摘要

我国是世界上鸡(Gallus gallus domesticus)种遗传资源最为丰富的国家之一,随着越来越多的培育品种不断出现,如何区分这些优良鸡种显得尤为重要.本研究旨在探讨线粒体D-loop区序列作为DNA条形码在识别鸡种方面的可行性和有效性.对安卡鸡、隐性白羽鸡、河南斗鸡以及丝羽乌骨鸡等4个鸡种共115个个体mtDNA D-loop区全序列进行测序,并分析各个鸡种遗传多态性特点以及种内和种间遗传距离.结果表明,4个鸡种D-loop区全序列大小为1 231～1 232bp,1 231 bp个体在859 bp处存在C碱基缺失,共检测到26个变异位点和15个单倍型,其中安卡鸡、隐性白羽鸡、河南斗鸡以及丝羽乌骨鸡特异单倍型数分别为3、4、3和2个.4个鸡种平均单倍型多样度为0.467～0.799,平均核苷酸多样度为0.00217～0.005 61,种间Kiumura双参数距离为0.435％～0.940％,种间净遗传距离为0.150％～0.712％.聚类分析显示,4个品种线粒体D-loop区分歧较远,聚类结果基本与形态学分类一致;参照己公开发表的单倍型划分标准,发现安卡鸡和隐性白羽鸡主要为E分支,河南斗鸡主要为B分支,丝羽乌骨鸡主要为A分支.本研究为鸡品种鉴定以及遗传资源保护和开发利用提供了理论依据.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	陆俊贤		41	149	7.0	11.0
2	高玉时		52	315	7.0	17.0
3	韩威		15	38	4.0	5.0
4	陈大伟		17	44	4.0	6.0
5	贾晓旭		28	82	6.0	8.0
6	唐修君		32	93	6.0	8.0
7	张小燕		17	19	3.0	4.0
8	唐梦君		23	53	5.0	7.0
9	樊艳风		1	2	1.0	1.0