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枇杷属内栽培种和部分野生种ITS序列分析
枇杷属内栽培种和部分野生种ITS序列分析
作者:
陈灼娟
基本信息来源于合作网站,原文需代理用户跳转至来源网站获取
枇杷属
ITS序列
变异位点
系统发育
摘要:
对不同栽培区的25种普通枇杷品种以及7种枇杷属野生种的ITS序列进行扩增并测序,采用邻接法和最大简约法进行系统发育树的构建并对枇杷属内不同种间的遗传关系进行了分析.结果表明:枇杷属植物ITS序列ITS1+5.8S rDNA+ITS2总长度为592 bp或594 bp,长度变化发生在ITS2.所有样本的ITS1和5.8S rDNA长度一样,都是223 bp和168 bp;而ITS2为201 bp或203 bp.5种枇杷属野生种的ITS序列长度为594 bp,包括栎叶枇杷、大渡河枇杷、南亚枇杷、南亚枇杷窄叶变种和大瑶山枇杷;其余2种枇杷属野生种(麻栗坡枇杷、小叶枇杷)和普通枇杷栽培种的ITS序列长度都为592 bp.所有样本ITS序列的GC含量为64.2%~64.5%,其中ITS1为64.1%~65.5%,ITS2为68.1%~72.6%.对所有样本的ITS序列比对产生44个可变位点,其中38个为简约信息位点,其中11个位于ITS1,5个位于5.8S rDNA,22个位于ITS2.最大的种间序列差异为7.7%,最小的种间差异发生在麻栗坡枇杷和小叶枇杷之间,仅为0.2%.普通枇杷种内的ITS序列差异很低,25种普通枇杷栽培种之间的序列差异为0~1.5%.所研究的枇杷属植物可分为3个分支.分支Ⅰ包括所有普通枇杷品种,分支Ⅱ包含5种野生枇杷种,包括栎叶枇杷、大渡河枇杷、南亚枇杷、南亚枇杷窄叶变种和大瑶山枇杷;分支Ⅲ由2个野生枇杷种(麻栗坡枇杷、小叶枇杷)组成.该研究结果表明ITS序列对枇杷种间鉴定和系统发育分析具有一定意义,但对普通枇杷栽培种间的鉴定作用不大.
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文献信息
篇名
枇杷属内栽培种和部分野生种ITS序列分析
来源期刊
广西植物
学科
生物学
关键词
枇杷属
ITS序列
变异位点
系统发育
年,卷(期)
2017,(11)
所属期刊栏目
植物系统与进化
研究方向
页码范围
1447-1454
页数
8页
分类号
Q781|Q949
字数
4190字
语种
中文
DOI
10.11931/guihaia.gxzw201706010
五维指标
作者信息
序号
姓名
单位
发文数
被引次数
H指数
G指数
1
陈灼娟
福州大学至诚学院生物工程系
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节点文献
枇杷属
ITS序列
变异位点
系统发育
研究起点
研究来源
研究分支
研究去脉
引文网络交叉学科
相关学者/机构
期刊影响力
广西植物
主办单位:
广西壮族自治区广西植物研究所
中国科学院广西植物研究所
广西植物学会
出版周期:
月刊
ISSN:
1000-3142
CN:
45-1134/Q
开本:
大16开
出版地:
广西桂林市雁山镇85号广西植物研究所《广西植物》编辑部
邮发代号:
48-43
创刊时间:
1981
语种:
chi
出版文献量(篇)
3580
总下载数(次)
1
总被引数(次)
42592
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