嗜麦芽窄食单胞菌外膜蛋白OmpA的生物信息学分析

• 作者: 刘鹏 尚学义 李燕 李艳 汤雪萍 赵尊全
• 来源期刊: 军事医学
• 学科: 医学
• 关键词: 嗜麦芽窄食单胞菌 外膜蛋白A 生物信息学 结构 功能 抗原决定簇
• 年，卷（期）: 2017,（12）
• 所属期刊栏目: 论著
• 页码范围: 987-990
• 页数: 4页
• 分类号: R378
• 字数: 3558字
• 语种: 中文
• DOI: 10.7644/j.issn.1674-9960.2017.12.009

摘要

目的 对嗜麦芽窄食单胞菌外膜蛋白A(OmpA)的结构和功能进行预测与分析.方法 利用生物信息学软件和生物数据库对OmpA蛋白的理化性质、信号肽、跨膜区、亚细胞定位、二级与三级结构、同源性、保守结构域及抗原决定簇进行预测分析.结果 OmpA蛋白为亲水性蛋白,其1~22位氨基酸为信号肽序列,无跨膜结构并定位于细胞膜外;二级结构中含无规则卷曲、α-螺旋、β-转角和 β-片层比例分别为50.27%、24.59%、9.29%和15.85%;三级结构预测OmpA蛋白为桶状蛋白;OmpA蛋白在不同嗜麦芽窄食单胞菌株间高度保守,而与人、小鼠的蛋白序列进行比对分析未找到同源序列;OmpA蛋白保守结构域在N端为OM膜通道蛋白超家族,在C端为OmpA_C超家族;OmpA蛋白含有11个优势抗原决定簇区域.结论 通过对OmpA进行生物信息学分析获得该蛋白的特性,不仅为进一步研究该蛋白的结构与功能提供参考资料,也为研制相关亚单位疫苗提供理论依据.