维氏气单胞菌吉林分离株外膜蛋白AⅡ基因的克隆及生物信息学分析

• 作者: 单晓枫 吴同垒 孟庆峰 王伟利 钱爱东
• 来源期刊: 中国人兽共患病学报
• 学科: 医学
• 关键词: 维氏气单胞菌 外膜蛋白AⅡ 克隆 序列分析 生物信息学
• 年，卷（期）: 2011,（12）
• 所属期刊栏目: 论著
• 页码范围: 1082-1085
• 分类号: R917.1
• 字数: 2698字
• 语种: 中文
• DOI: 10.3969/j.issn.1002-2694.2011.12.004

摘要

目的 克隆维氏气单胞菌(Aeromonas veronii,AV)吉林株外膜蛋白AⅡ(OMPAⅡ)基因,并对其编码蛋白进行生物信息学分析.方法 根据维氏气单胞菌已知OMPAⅡ基因序列设计合成一对引物,通过PCR技术扩增OMPAⅡ基因,并将其克隆到pMD18-T载体上,阳性重组质粒经PCR鉴定后进行序列测定,通过BlastN分析维氏气单胞菌OMPAⅡ基因序列与其他菌种OMPAⅡ序列同源性,并构建系统进化树,同时对维氏气单胞菌OMPAⅡ蛋白进行生物信息学分析.结果 克隆基因长1 001 bp,与GenBank报道的基因序列同源性为95％,生物信息学软件分析OMPAⅡ蛋白无跨膜区,其N端含有1个信号肽,二级结构以β折叠和β转角为主,有10个区域可能存在B细胞抗原表位.结论 成功的克隆维氏气单胞菌OMPAⅡ基因,并对OMPAⅡ蛋白的相关生物信息学进行了分析.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	单晓枫	吉林农业大学动物科学技术学院	111	518	11.0	19.0
2	钱爱东	吉林农业大学动物科学技术学院	283	1216	15.0	21.0
3	王伟利		70	397	10.0	16.0
4	孟庆峰		43	273	10.0	14.0
5	吴同垒	吉林农业大学动物科学技术学院	9	136	6.0	9.0