框镜鲤维氏气单胞菌CY0806株鞭毛flaA基因的克隆与生物信息学分析

• 作者: 单晓枫 吴同垒 孟庆峰 王伟利 钱爱东
• 来源期刊: 华南农业大学学报
• 学科: 农学
• 关键词: 框镜鲤 维氏气单胞菌 flaA基因 生物信息学
• 年，卷（期）: 2012,（1）
• 所属期刊栏目: 动物科学与兽医学
• 页码范围: 92-95
• 分类号: S941.42
• 字数: 2750字
• 语种: 中文
• DOI: 10.3969/j.issn.1001-411X.2012.01.019

摘要

以框镜鲤Cyprinus carpio维氏气单胞菌Aeromonas veronii CY0806株细菌基因组DNA为模板,经PCR扩增,获得flaA基因,将其克隆并测序,测序结果与气单胞菌属的不同菌株进行相似性分析,并对flaA基因编码蛋白质进行生物信息学分析.结果显示:获得框镜鲤维氏气单胞菌鞭毛flaA基因,长915 bp,编码304个氨基酸,系统进化树分析,其与其他维氏气单胞菌flaA基因处于同一分支,相关生物信息学分析显示,flaA基因编码的蛋白质相对分子质量32 098.66,等电点5.57,半衰期30 h,不稳定系数为32.31,脂肪系数81.05,不存在信号肽和跨膜区,二级结构预测:flaA基因以α螺旋和β折叠为主,同时,以同源建模法预测了flaA基因编码蛋白的三维立体结构.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	单晓枫	吉林农业大学动物科学技术学院	111	518	11.0	19.0
2	钱爱东	吉林农业大学动物科学技术学院	283	1216	15.0	21.0
3	王伟利		70	397	10.0	16.0
4	孟庆峰		43	273	10.0	14.0
5	吴同垒	吉林农业大学动物科学技术学院	9	136	6.0	9.0