引起手足口病的柯萨奇病毒A10型云南分离株的VP1基因遗传特征分析

• 作者: 周晓芳 姜黎黎 寸建萍 徐闻 田子颖 田炳均
• 来源期刊: 中国病毒病杂志
• 学科: 医学
• 关键词: 手足口病 柯萨奇病毒A10型 基因型 亲缘进化分析
• 年，卷（期）: 2017,（2）
• 所属期刊栏目: 手足口病专题 论著
• 页码范围: 96-99
• 页数: 4页
• 分类号: R373.2
• 语种: 中文
• DOI: 10.16505/j.2095-0136.2017.02.003

摘要

目的 分析云南省手足口病(hand,foot and mouth disease,HFMD)患儿标本中柯萨奇病毒A10型(coxsackievirus A10,CV-A10)病毒VP1区基因特征.方法 采集2012-2014年云南省HFMD患者粪便和咽拭子标本,用细胞培养法分离病毒,提取病毒RNA,用RT-PCR法进行病毒VP1区基因序列测定,用基因分型方法鉴定病毒的血清型和基因型别.按文献选择CV-A10各基因型的代表株,用MEGA 5.0软件构建CV-A10基因进化树并分析核苷酸和氨基酸的同源性.结果 2012-2014年云南省共采集到21 761份HFMD病例的临床标本,对其中的2 578份标本进行病毒分离,共分离到608株病毒,其中17株为CV-A10.它们之间的核苷酸(nucleotide,nt)和氨基酸(amino acid,aa)同源性分别为94.30％～100.00％和98.04％～ 100.00％,与原型株(Kowalik,AF081300)的nt和aa同源性为76.23％～ 76.71％和91.18％～92.65％.基因进化分析表明CV-A10云南分离株为C基因型,它们又分为两个进化分支.结论 CV-A10是除EV-A71和CV-A16外引起手足口病的重要病原之一,和国内报道一样,云南省流行的CV-A10为C基因型,2012-2014年有两个进化分支在云南共同流行.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	徐闻		60	312	10.0	14.0
2	田炳均		40	74	5.0	7.0
3	田子颖		15	26	4.0	4.0
4	寸建萍		17	77	5.0	8.0
5	姜黎黎		12	37	3.0	6.0
6	周晓芳		10	32	3.0	5.0