REV感染DF-1细胞分泌外体的生物信息学分析

• 作者: 孙霞 庄萍萍 成子强 杜旭升 王小满 王晓宇 王桂花
• 来源期刊: 中国细胞生物学学报
• 关键词: REV 外体 肌动蛋白细胞骨架信号通路 致瘤性
• 年，卷（期）: 2017,（12）
• 所属期刊栏目: 研究论文
• 页码范围: 1565-1572
• 页数: 8页
• 语种: 中文
• DOI: 10.11844/cjcb.2017.12.0234

摘要

该研究探讨了REV感染DF-1细胞分泌外体携带表达差异的蛋白质和微RNA(microRNA,miRNA),及其基因功能和参与的信号通路,为病毒致病机制研究提供了基础.通过蛋白组学和转录组学检测技术,筛选病毒感染组与对照组DF-1细胞分泌外体的差异蛋白质和miRNA,并利用在线软件数据库对其进行GO功能富集和KEGG信号通路分析.结果筛选到101个差异表达蛋白质,其中56个表达上调,45个表达下调,共参与155条信号通路,参与蛋白质最多的是肿瘤相关通路;并筛选到3个表达上调的miRNA,其中miRNA-155、miRNA-146a-3p编码的靶蛋白(整合蛋白)与差异蛋白质肌动蛋白相关2/3复合体(actinrelated 2/3 complexs,Arp2/3)共同参与肌动蛋白细胞骨架信号通路;差异蛋白质及miRNA编码靶基因均含有病毒成分,并参与细胞信号转导、免疫、黏附、运动、生物调节等过程.该研究结果表明,REV感染DF-1细胞来源外体表达差异的蛋白质和miRNA及其参与的生物学过程和信号通路与肿瘤形成密切相关,外体途径可能在REV致瘤机制中具有重要作用.