多歧性状上位性关联分析的分层广义混合线性模型方法

• 作者: 倪元丽 冯建英 岳秀丽 章元明
• 来源期刊: 南京农业大学学报
• 学科: 生物学
• 关键词: 上位性 品种群体 多歧性状 全基因组关联分析 广义线性混合模型
• 年，卷（期）: 2017,（2）
• 所属期刊栏目: 研究论文
• 页码范围: 211-218
• 页数: 8页
• 分类号: Q37
• 字数: 6391字
• 语种: 中文
• DOI: 10.7685/jnau.201608015

摘要

[目的]作物抗性性状是重要的育种目标,通常表现为多个级别,称为多歧性状.但是,这类性状的上位性关联分析方法较少.因此,本研究针对品种资源群体探索了新的多歧性状上位性检测方法.[方法]提出了多歧性状分层广义混合线性模型的上位性关联分析方法.在遗传模型中,主效QTL、QTL间互作和QTL-环境互作为随机效应,群体平均数、群体结构和环境效应为固定效应.应用经验贝叶斯和最大似然方法分别估计这些效应.一系列Monte Carlo模拟试验和大豆耐盐碱性实际数据分析验证了新方法的有效性.[结果]新方法的统计功效高,效应估计值精度好;检测结果会受遗传率、表型分类数、表型分布、Founders数和Non-founders数的影响.用新方法分析了257份大豆品种幼苗根长耐盐碱性指数分级数据,检测到2个主效QTL、4个上位性QTL和3个QTL-环境互作,其中11个标记与其他方法或以前结果一致.[结论]本研究为植物上位性关联分析提供了新方法.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	章元明	华中农业大学植物科技学院	2	27	1.0	2.0