Sanger和Pyrosequencing测序法分析健康成人口腔菌群

• 作者: 于卫强 张富强 田菲 郭晓奎
• 来源期刊: 中国微生态学杂志
• 学科: 医学
• 关键词: 口腔菌群 Sanger测序 Pyrosequencing测序
• 年，卷（期）: 2017,（7）
• 所属期刊栏目: 口腔微生态学
• 页码范围: 801-806
• 页数: 6页
• 分类号: R781.2
• 语种: 中文
• DOI: 10.13381/j.cnki.cjm.201707013

摘要

目的 对比Sanger和Pyrosequencing测序法分析健康人口腔菌群组成.方法 收集6例健康成人唾液、舌背、黏膜、龈上及龈下菌斑并构建16S rRNA基因文库,分别用Sanger和Pyrosequencing测序法分析.结果 Sanger测序所得已知的序列有5,794条(占6,535总序列数88.7％)、75个属,396个序列划分操作分类单元(operational taxonomic units,OTUs,占总OTUs的61.4％).Pyrosequencing测序所得已知的序列有10,771条(占11,103总序列数97.0％)、66个属,322个OTUs(占总OTUs的68.0％).Sanger和Pyrosequencing测序法所得口腔菌群在门、属的水平分布趋势基本一致,但在种的水平分布差异显著.Sanger和Pyrosequencing测序法构建的口腔菌群文库均匀度值分别为0.016和0.007,说明Pyrosequencing分析口腔菌群物种数量分布比Sanger测序方法的文库均匀性稍差,但优势种更显著.结论 Pyrosequencing测序时所构建基因文库能代表口腔菌群的多样性且经济、省时,可以应用于口腔细菌物种的分析.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	张富强	上海交通大学医学院附属第九人民医院口腔修复科	55	431	12.0	18.0
2	郭晓奎	上海交通大学医学院病原生物学教研室	118	601	12.0	19.0
3	于卫强	上海交通大学医学院附属第九人民医院口腔修复科	9	31	4.0	5.0
4	田菲	上海交通大学医学院病原生物学教研室	8	38	5.0	6.0