应用16S rRNA 高通量测序法比较人与常用实验动物口腔菌群的异同

• 作者: 刘海月 周宏伟 江霞 那顺巴雅尔 陈傍柱 顾东曙 顾为望
• 来源期刊: 中国比较医学杂志
• 学科: 医学
• 关键词: 实验动物 口腔菌群 16S rRNA 西藏小型猪 比格犬 猕猴 新西兰兔 Wistar 大鼠
• 年，卷（期）: 2016,（8）
• 所属期刊栏目: 研究报告
• 页码范围: 96-102
• 页数: 7页
• 分类号: R-33
• 字数: 4990字
• 语种: 中文
• DOI: 10.3969/j.issn.1671-7856.2016.08.016

摘要

目的：应用16S rRNA 高通量测序法测定几种常用实验动物（西藏小型猪、比格犬、猕猴、新西兰兔、Wistar 大鼠）的口腔菌群，并和人的口腔菌群进行对比分析，为口腔微生态的动物模型研究提供基础性资料。方法用一次性棉拭子采集西藏小型猪、比格犬、猕猴、新西兰兔、Wistar 大鼠和人的口腔菌群标本，提取样品总 DNA，使用带标签的通用引物扩增16S rRNA V4区片段，Illumina 测序，经 BIPES 以及 QIIME 分析比较菌群多样性及结构。结果人与5种常用实验动物口腔菌群的丰富度均差异显著（P ＜0．05），不同种类动物有其各自独特的口腔菌群，但猴的口腔菌群与人最为相似。结论根据与人口腔某类菌群的相似程度，5种动物中，猴口腔的梭菌属（Fusobacterium）、卟啉菌属（Porphyromonas）水平与人最相似，提示猴可能是研究人口腔菌群较适宜的模型动物。从特定菌门角度，西藏小型猪可能是研究与变形菌门（Proteobacteria）相关疾病的较适宜模型动物；比格犬可能是研究与螺旋体门（Spirochaetes）相关疾病的较适宜模型动物。

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	顾为望	南方医科大学实验动物中心	149	929	15.0	22.0
2	周宏伟	南方医科大学珠江医院检验医学部	27	192	7.0	13.0
3	顾东曙	南方医科大学实验动物中心	3	8	2.0	2.0
4	那顺巴雅尔		5	7	2.0	2.0
5	陈傍柱	南方医科大学实验动物中心	4	6	2.0	2.0
6	江霞	南方医科大学实验动物中心	5	27	3.0	5.0
7	刘海月	南方医科大学公共卫生与热带医学学院	1	2	1.0	1.0