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基于RNA-seq分析美洲大蠊提取物对结直肠癌细胞信号通路的影响
基于RNA-seq分析美洲大蠊提取物对结直肠癌细胞信号通路的影响
作者:
彭锐
耿福能
邹方东
陈佳松
陈峰
基本信息来源于合作网站,原文需代理用户跳转至来源网站获取
美洲大蠊
提取物
转录组
差异基因
信号通路
功能注释
摘要:
美洲大蠊Periplaneta americana提取物能够抑制多种肿瘤细胞生长,甚至能使肿瘤细胞发生凋亡,但是其对结直肠癌细胞信号通路的影响尚不清楚.本文基于RNA-seq技术初步分析了美洲大蠊提取物联合顺铂处理结直肠癌细胞后,细胞内信号通路的变化.结果表明:30 μM顺铂和0.6%康复新液联合处理组与对照组相比,共有1 901个差异基因,其中1 555个基因表达上调,346个基因表达下调;30 μM顺铂和0.8%精粉酵解液联合处理组与对照组比,共有2 587个差异基因,其中2 183个基因表达上调,404个基因表达下调;30 μM顺铂和100 μg·mL-1精粉联合处理组与对照组相比,共有1 488个差异基因,其中1 164个基因表达上调,324个基因表达下调.用WEGO和DAVID进行差异基因的GO和KEGG富集分析发现,美洲大蠊提取物联合顺铂处理组与对照组相比,表达上调的差异基因主要富集在p53、细胞粘附分子、MAPK、细胞凋亡等信号通路;表达下调的差异基因主要富集在氨基酰-tRNA生物合成、氨基酸生物合成、抗生素生物合成、一碳代谢等信号通路.
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篇名
基于RNA-seq分析美洲大蠊提取物对结直肠癌细胞信号通路的影响
来源期刊
四川动物
学科
生物学
关键词
美洲大蠊
提取物
转录组
差异基因
信号通路
功能注释
年,卷(期)
2017,(6)
所属期刊栏目
研究报告
研究方向
页码范围
649-656
页数
8页
分类号
Q965.9
字数
3969字
语种
中文
DOI
10.11984/j.issn.1000-7083.20170105
五维指标
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信号通路
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研究去脉
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期刊影响力
四川动物
主办单位:
四川省动物学会
四川省野生动植物保护协会
四川大学
成都大熊猫繁育研究基金会
出版周期:
双月刊
ISSN:
1000-7083
CN:
51-1193/Q
开本:
大16开
出版地:
成都市望江路29号四川大学生命科学学院内
邮发代号:
创刊时间:
1981
语种:
chi
出版文献量(篇)
4190
总下载数(次)
12
总被引数(次)
21965
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