基于RNA-seq分析美洲大蠊提取物对结直肠癌细胞信号通路的影响

• 作者: 彭锐 耿福能 邹方东 陈佳松 陈峰
• 来源期刊: 四川动物
• 学科: 生物学
• 关键词: 美洲大蠊 提取物 转录组 差异基因 信号通路 功能注释
• 年，卷（期）: 2017,（6）
• 所属期刊栏目: 研究报告
• 页码范围: 649-656
• 页数: 8页
• 分类号: Q965.9
• 字数: 3969字
• 语种: 中文
• DOI: 10.11984/j.issn.1000-7083.20170105

摘要

美洲大蠊Periplaneta americana提取物能够抑制多种肿瘤细胞生长,甚至能使肿瘤细胞发生凋亡,但是其对结直肠癌细胞信号通路的影响尚不清楚.本文基于RNA-seq技术初步分析了美洲大蠊提取物联合顺铂处理结直肠癌细胞后,细胞内信号通路的变化.结果表明:30 μM顺铂和0.6％康复新液联合处理组与对照组相比,共有1 901个差异基因,其中1 555个基因表达上调,346个基因表达下调;30 μM顺铂和0.8％精粉酵解液联合处理组与对照组比,共有2 587个差异基因,其中2 183个基因表达上调,404个基因表达下调;30 μM顺铂和100 μg·mL-1精粉联合处理组与对照组相比,共有1 488个差异基因,其中1 164个基因表达上调,324个基因表达下调.用WEGO和DAVID进行差异基因的GO和KEGG富集分析发现,美洲大蠊提取物联合顺铂处理组与对照组相比,表达上调的差异基因主要富集在p53、细胞粘附分子、MAPK、细胞凋亡等信号通路;表达下调的差异基因主要富集在氨基酰-tRNA生物合成、氨基酸生物合成、抗生素生物合成、一碳代谢等信号通路.