干旱胁迫棉花转录组DNA损伤修复相关基因的分析

• 作者: 包秋娟 张丽丽 张富春 海那尔·乌拉孜巴依
• 来源期刊: 新疆农业科学
• 学科: 农学
• 关键词: 棉花 干旱胁迫 转录组测序 DNA损伤修复相关基因 差异表达
• 年，卷（期）: 2017,（11）
• 页码范围: 1999-2005
• 页数: 7页
• 分类号: S562|Q756
• 字数: 5004字
• 语种: 中文
• DOI: 10.6048/j.issn.1001-4330.2017.11.005

摘要

[目的]研究干旱胁迫下,棉花DNA损伤修复基因的表达情况,从整体水平探讨棉花DNA损伤修复相关基因表达与抗旱的相关性.[方法]用2.5％ PEG6000处理棉花幼苗,利用RNA-Seq技术对干旱胁迫下棉花幼苗的转录组进行测序.[结果]从棉花干旱胁迫响应的转录组中,筛选获得差异表达的DNA损伤修复相关基因共51个,其中差异表达的上调基因23个,差异表达的下调基因28个,干旱胁迫能够影响棉花DNA损伤修复相关基因的表达.选取4个差异基因进行生物信息学分析及qRT-PCR验证,HMGB1、recA1、UDGs和GMP synthase基因的表达变幅有一定的差异,但基因的表达趋势一致,棉花转录组测序结果通过qRT-PCR验证是可靠的.[结论]DNA损伤修复相关基因可能与干旱胁迫有一定的相关性,干旱胁迫能够影响棉花DNA损伤修复相关基因的表达.