2015年盐城市甲型H3N2亚型流感病毒HA1基因分子进化特征分析

• 作者: 徐士林 李春香 李长城 王瑶 邵荣标 陈国清
• 来源期刊: 江苏预防医学
• 学科: 医学
• 关键词: 流感 甲型H3N2病毒 RT-PCR HA1基因 序列分析
• 年，卷（期）: 2017,（2）
• 所属期刊栏目: 病原检测专题论著
• 页码范围: 137-140
• 页数: 4页
• 分类号: R511.7
• 字数: 3573字
• 语种: 中文
• DOI: 10.13668/j.issn.1006-9070.2017.02.05

摘要

目的 了解盐城市2015年甲型H3N2流感病毒分离株表面血凝素HA1基因分子进化特征.方法 对哨点医院流感样病例标本进行核酸检测、病毒分离;选取甲型H3N2毒株,采用一步法RT-PCR扩增其HA1区,并进行序列分析,采用DNAStar软件包中MegAlign进行核苷酸及氨基酸同源性分析,以MEGA6.0软件进行序列比对及基因种系进化特征分析.结果 2015年盐城市流感样病例(ILI)监测样本中流感病毒核酸阳性率为8.36％,乙型、甲型H3N2、新甲H1N1型交替流行.抽取的7株甲型H3N2分离株,其HA1基因核苷酸同源性为98.7％～100.0％,氨基酸同源性为97.9％～100.0％;其HA1区氨基酸位点变异呈散在性分布,均未发生氨基酸的丢失和插入,氨基酸突变主要位于抗原决定簇的A、B和C区.除A/JSYC/11025/2015外,其余6株新增2个糖基化位点,其中158 aa位点位于抗原决定簇B区.结论 2015年盐城市流感流行以甲型H3N2和乙型Yamagata系为主,具有典型的冬、夏双高峰特点.病毒HA1区基因特性逐渐发生变异,可能导致抗原变化,应进一步加强流感病原学监测.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	王瑶		6	8	2.0	2.0
2	陈国清		2	3	1.0	1.0
3	李春香		1	3	1.0	1.0
4	邵荣标		1	3	1.0	1.0
5	徐士林		2	8	2.0	2.0
6	李长城		2	8	2.0	2.0