猪流行性腹泻病毒ORF3基因的克隆及序列分析

• 作者: 唐明霞 张德志 易华山 毕俊萱 王芝英 马鲜平
• 来源期刊: 西北农业学报
• 学科: 农学
• 关键词: 猪流行性腹泻病毒 ORF3基因 序列分析
• 年，卷（期）: 2017,（7）
• 页码范围: 968-974
• 页数: 7页
• 分类号: S851.34
• 字数: 5152字
• 语种: 中文
• DOI: 10.7606/j.issn.1004-1389.2017.07.002

摘要

为研究2015年重庆市荣昌部分腹泻猪场是否有猪流行性腹泻病毒的感染与流行,对猪流行性腹泻病毒ORF3 (Open reading flame 3)基因进行克隆及序列分析研究.通过从疑似流行性腹泻病毒感染的猪场采集小肠组织,采用RT-PCR方法对猪流行性腹泻病毒的ORF3基因进行克隆.结果表明,所获得的ORF3基因ORF长675bp,编码223个氨基酸.通过DNAMAN软件分析,表明本研究中克隆的ORF3基因与CV777标准株(AF353511)的ORF3基因相似性为96.45％,与中国的NJ (KJ642645)的相似性最高,为99.41％,与attenuated DR13疫苗株(EU054930)相似性90.52％,而与CV777疫苗株(GU372744)相似性仅79.07％.系统进化树分析表明,该基因与中国毒株、韩国毒株以及美国分离株USA/ Illinois 201/2014(KR265795)处于同一进化分支上,而attenuated DR13疫苗株、CV777 truncated疫苗株和欧洲的CV777标准株处于另一个进化分支上,说明该基因与中国毒株、韩国毒株的遗传距离最近.通过B细胞抗原表位预测分析,发现其氨基酸第65～68、114～116、137～140和150～154区域可能有潜在的优势抗原表位.成功克隆了猪流行性腹泻病毒ORF3基因,说明2015年重庆市荣昌部分腹泻猪场存在猪流行性腹泻病毒的感染.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	王芝英	西南大学荣昌校区动物医学系	30	104	5.0	9.0
2	唐明霞	西南大学荣昌校区动物医学系	8	9	2.0	2.0
3	张德志	西南大学荣昌校区动物医学系	37	142	6.0	11.0
4	马鲜平	西南大学荣昌校区动物医学系	17	26	3.0	4.0
5	毕俊萱	西南大学荣昌校区动物医学系	3	4	2.0	2.0
6	易华山	西南大学荣昌校区动物医学系	8	9	2.0	2.0