基于通路分析方法诠释肉鸡体重性状全基因组关联研究

• 作者: 刘冉冉 刘杰 刘璐 文杰 王杰 赵桂苹 郑麦青
• 来源期刊: 畜牧兽医学报
• 学科: 农学
• 关键词: SRT 通路 GWAS 体重 肉鸡
• 年，卷（期）: 2017,（5）
• 所属期刊栏目: 遗传育种
• 页码范围: 810-817
• 页数: 8页
• 分类号: S813.2
• 字数: 4333字
• 语种: 中文
• DOI: 10.11843/j.issn.0366-6964.2017.05.004

摘要

本研究旨在通过对体重和日增重进行基于通路的关联分析,以期获得影响体重和日增重的信号通路.对北京油鸡与科宝肉鸡F2资源群体14、28、56、93日龄体重及0～14、14～28、28～56、56～93日龄日增重分别进行全基因组关联分析,利用关联分析获得的显著性SNP位点进行基于通路的关联分析(SNP ratio test).结果表明,14日龄体重与类固醇激素的生物合成相关联(P＜0.05),56日龄体重与烟酸/烟酰胺的代谢相关联(P＜0.05),93日龄体重与糖酵解/糖异生相关(P＜0.05),且各日龄体重性状均与氨基酸的代谢过程相关联(P＜0.05).在增重最快的42～56日龄,与日增重相关的SNP富集到的通路最多,这些通路主要集中在TCA循环、类固醇合成、类固醇激素的生物合成、氧化磷酸化、磷酸肌醇代谢、甘油磷脂代谢等过程.在肉鸡体重迅速增长阶段类固醇激素的生物合成起到了重要作用,且氨基酸代谢过程与日增重显著相关.