草鱼野生与选育群体线粒体DNA控制区D-loop遗传变异分析

• 作者: 党云飞 张猛 方圆 李家乐 李立森 沈玉帮 王丰 王沈同 黄文吉
• 来源期刊: 水生生物学报
• 学科: 生物学
• 关键词: 草鱼 选育群体 野生群体 mtDNA D-loop 遗传变异
• 年，卷（期）: 2017,（5）
• 页码范围: 947-955
• 页数: 9页
• 分类号: Q349+.1
• 字数: 6920字
• 语种: 中文
• DOI: 10.7541/2017.118

摘要

为探究经过2个选育世代后选育群体遗传多样性和遗传结构的变化,研究对4个野生群体(邗江、九江、石首和吴江)和2个选育世代(F1和F2)进行了线粒体DNA控制区(D-loop)序列的遗传变异分析.实验结果表明,4个野生群体在单倍型数目(H)、单倍型多样性(Hd)、核苷酸多样性(π)、平均核苷酸差异数(K)水平上均高于2个选育世代,在2个选育世代内表现为F1代群体的核苷酸多样性(π)和平均核苷酸差异数(K)大于F2代群体,但单倍型多样性(Hd)小于F2代群体;单倍型分析结果表明,6个群体间无共享单倍型,4个野生群体间共发现2种共享单倍型(Hap1和Hap3),石首群体和2个选育世代共享1种单倍型(Hap15);遗传分化指数(Fst)分析结果表明,邗江、九江、吴江3个野生群体和2个选育世代间存在较大的遗传分化(Fst范围为0.41475—0.55128),石首群体与F1代群体之间存在较小的遗传分化,与F2代群体之间存在中等水平的遗传分化,同时F1代群体与F2代群体之间存在较小的遗传分化;基于6个群体276个个体构建的邻接(Neighbor-Joining,NJ)进化树和基于27种单倍型构建的单倍型网络图也得到了相似的结论,即邗江、九江、吴江3个野生群体和2个选育世代间的亲缘关系较远,石首群体和2个选育世代两两之间的亲缘关系较近.以上结果表明,经过2个世代的选择育种,选育群体的遗传结构已发生了变化,并且随着选育的进行,选育世代的遗传多样性下降的较为明显,这警示着我们在今后的育种工作中应适当改变现有的选育方案,并实时监测选育群体的遗传多样性,以便为今后进一步的选育工作打下坚实的基础.