丝瓜过氧化氢酶CAT2基因的分离及表达分析

• 作者: 刘建汀 张前荣 朱海生 林珲 温庆放 王彬 薛珠政 陈敏氡
• 来源期刊: 中国细胞生物学学报
• 关键词: 丝瓜 转录组测序 LcCAT2 荧光定量PCR
• 年，卷（期）: 2017,（8）
• 所属期刊栏目: 研究论文
• 页码范围: 1076-1083
• 页数: 8页
• 语种: 中文
• DOI: 10.11844/cjcb.2017.08.0136

摘要

该研究对普通丝瓜品种‘WL-3’的褐变果肉开展转录组测序,对高质量片段进行拼接和组装后获得58 073条unigenes序列,其中,27 301条unigenes在褐变前后表达水平发生变化.从差异表达的基因中筛选得到1条功能注释为过氧化氢酶(catalase,CAT)的基因全长序列(unigene0033876).分析发现,该序列全长1 690 bp,包含1个1 479 bp的开放读码框(open reading frame,ORF),预测编码492个氨基酸,理论分子量(molecular weight,Mw)为56.94 kDa,等电点(isoelectric point,pI)为7.31,编码的蛋白质与葫芦科作物南瓜、西葫芦和黄瓜中同源蛋白质的相似性均在97％以上,显示其高度的保守性,基因命名为LcCAT2,GenBank登录号为KR184674.荧光定量PCR分析结果表明,LcCAT2基因具有组织表达特异性,在丝瓜叶片中表达量最高,花中表达量最低.LcCAT2基因在所选的6个丝瓜品种中的表达量存在一定的差异,普通丝瓜中的表达量均高于有棱丝瓜.LcCAT2基因在普通丝瓜品种‘WL-3’采后储藏条件下的表达量随时间增加而呈上调表达趋势.初步推测,LcCAT2基因在丝瓜果肉褐变过程中起着一定的调控作用.该研究旨在从转录组测序结果中挖掘与丝瓜果肉褐变相关的基因,为今后丝瓜品种的选育及进一步揭示其酶促褐变产生的分子机制奠定理论基础.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	薛珠政		79	312	10.0	14.0
2	温庆放		108	864	14.0	25.0
3	朱海生		53	277	10.0	14.0
4	林珲		33	137	8.0	11.0
5	张前荣		15	7	1.0	2.0
6	刘建汀		15	5	1.0	2.0
7	王彬		18	5	1.0	2.0
8	陈敏氡		23	23	2.0	4.0