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H9N2亚型禽流感病毒河南分离株的全基因克隆及序列分析
H9N2亚型禽流感病毒河南分离株的全基因克隆及序列分析
作者:
孙乾晋
张宇
张静
李如意
李昕键
白牧原
蔺文成
谢青梅
陈立根
雷小亚
基本信息来源于合作网站,原文需代理用户跳转至来源网站获取
禽流感病毒
H9N2
基因组
核苷酸
氨基酸
摘要:
为了研究H9N2亚型禽流感病毒的基因组变异情况,试验以一株2015年在河南省分离的H9N2亚型Ck/HN/12/15为研究对象,用RT-PCR方法扩增病毒基因组的8个基因片段并进行克隆和测序,将测序结果与GenBank公布的H9N2参考毒株序列进行比对分析,绘制各基因片段的进化树.结果表明:分离株的PB1、PA、NP、NS基因与1998年中国上海鸡源毒株Ck/SH/F/98(H9N2)归于同一进化分支,核苷酸序列同源性分别为93.57%、90.48%、87.66%和86.64%.分离株的HA、NA基因与1997年中国香港鸭源毒株Dk/HK/Y280/97 (H9N2)属同一个进化分支,核苷酸序列同源性分别为87.62%和85.32%.该毒株裂解位点处的序列是PSRSSR,符合低致病性禽流感病毒的分子特点.该株HA基因的226位(对应H3亚型位置)氨基酸为Leu,更易与哺乳动物唾液酸受体结合.说明应该做好对此类H9N2亚型禽流感病毒免疫防控工作,避免在人和禽类之间传播.
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文献信息
篇名
H9N2亚型禽流感病毒河南分离株的全基因克隆及序列分析
来源期刊
黑龙江畜牧兽医(上半月)
学科
农学
关键词
禽流感病毒
H9N2
基因组
核苷酸
氨基酸
年,卷(期)
2017,(6)
所属期刊栏目
试验研究
研究方向
页码范围
5-9
页数
5页
分类号
S852.65+9.5|Q785
字数
语种
中文
DOI
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姓名
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谢青梅
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张宇
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禽流感病毒
H9N2
基因组
核苷酸
氨基酸
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黑龙江畜牧兽医(上半月)
主办单位:
黑龙江省畜牧兽医学会
出版周期:
月刊
ISSN:
1004-7034
CN:
23-1205/S
开本:
出版地:
哈尔滨市香坊区哈平路243号
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语种:
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