辣椒轻斑驳病毒湖南分离物的全基因序列测定及结构分析

• 作者: 刘湘宁 唐前君 戴良英 李魏 董铮
• 来源期刊: 植物保护
• 学科: 农学
• 关键词: 辣椒 辣椒轻斑驳病毒 全基因序列 序列分析
• 年，卷（期）: 2017,（2）
• 所属期刊栏目: 研究报告
• 页码范围: 88-94
• 页数: 7页
• 分类号: S432.41
• 字数: 4355字
• 语种: 中文
• DOI: 10.3969/j.issn.0529-1542.2017.02.014

摘要

采自湖南地区的辣椒轻斑驳病毒Pepper mild mottle virus (PMMoV)样品经单斑分离后,根据已经报道的PMMoV序列基因保守区设计6对简并引物,采用片段重叠法和RACE方法扩增、克隆获得一个全长为6 356 bp的湖南分离物(PMMoV-HN1,登录号:KP345899)全基因组序列,编码4个蛋白,分别为126 kD蛋白(70～3 423 nt)、183 kD蛋白(70～4 908 nt)、28 kD蛋白(4 909～5 682 nt)和17.5 kD蛋白(5 685～6 158 nt),5'-非编码区(5'-UTR)和3'-非编码区(3'UTR)分别含有69和198个碱基,其中5'-UTR存在一个序列为m7G5'pppG的甲基化核苷酸帽子结构.一致性分析发现PMMoV-HN1与PMMoV其他分离物的核酸一致性为94％～99％,编码的氨基酸一致性为94％～99％.全基因组序列系统进化分析表明PMMoV-.HN1分离物与中国首次报道的PMMoV-CN分离物亲缘关系最近.本研究是国内报道的第二例PMMoV全基因组序列.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	戴良英	湖南农业大学植物保护学院	110	1718	22.0	38.0
3	刘湘宁	湖南农业大学植物保护学院	2	7	1.0	2.0
9	李魏	湖南农业大学植物保护学院	27	142	6.0	11.0
13	董铮	湖南农业大学植物保护学院	8	31	3.0	5.0
17	唐前君	湖南农业大学植物保护学院	27	167	9.0	12.0