辣椒脉斑驳病毒湖南分离物全基因组序列测定及分子特征

• 作者: 刘勇 卜姗 张宇 张德咏 张松柏 罗香文 谭汝晴
• 来源期刊: 福建农业学报
• 学科: 农学
• 关键词: 辣椒脉斑驳病毒 全基因组序列 系统发育分析 RNA突变和重组
• 年，卷（期）: 2020,（2）
• 所属期刊栏目: 植物保护
• 页码范围: 187-191
• 页数: 5页
• 分类号: S436.418.1+2
• 字数: 2699字
• 语种: 中文
• DOI: 10.19303/j.issn.1008-0384.2020.02.009

摘要

[目的]辣椒脉斑驳病毒(Chilli veinal mottle virus,ChiVMV)是东南亚茄科作物主产地主要病毒种类之一,严重危害辣椒等茄科作物的生产.测定ChiVMV的全基因组序列,分析其分子特征,可以明确该病毒的适应性进化以及对我国辣椒等茄科作物的潜在威胁提供科学基础.[方法]以湖南疑似感染ChiVMV辣椒为样本,采用small RNA高通量测序结合RT-PCR测定病毒全基因组序列,利用Mega、RDP及DnaSP等生物学软件分析其分子特征.[结果]ChiVMV湖南分离物全长基因组序列为9704 nt(不包含3′-A尾),与其他分离物的序列同源性为84％～94％.系统发育分析表明,我国的ChiVMV聚类为一个亚簇,与其他国家和地区分离物不存在重组事件.基因的替换指数R=3.29,替换碱基类型主要是C/T替换.[结论]碱基替换突变可能是ChiVMV湖南分离物适应性进化的主要因素.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	罗香文		23	213	8.0	14.0
2	张德咏	湖南农业大学植物保护学院	66	550	14.0	19.0
4	张松柏	湖南农业大学植物保护学院	40	375	13.0	18.0
6	刘勇	湖南农业大学植物保护学院	22	153	7.0	11.0
9	张宇		2	6	1.0	2.0
10	谭汝晴	湖南农业大学植物保护学院	1	0	0.0	0.0
11	卜姗		1	0	0.0	0.0