湖南益阳黑茶中桔青霉线粒体全基因组序列测定及分析

• 作者: 胡治远 刘素纯 徐正刚 刘石泉 文欣
• 学科: 农学
• 关键词: 黑茶 桔青霉 线粒体基因组 系统发育
• 年，卷（期）: 2022,（6）
• 所属期刊栏目: 研究报告
• 页码范围: 830-844
• 页数: 14页
• 分类号: S571.1,Q939.5
• 语种: 中文

摘要

对黑茶中分离的一株桔青霉线粒体基因序列进行测定与分析，并探究其与近缘种微生物的系统发育关系。结果表明，桔青霉线粒体基因组是一条全长27537bp的环状DNA分子，共编码42个基因（15个蛋白质编码基因，2个rRNA，24个tRNA以及1个独立的ORF），基因组碱基构成为：A（36.17%）、T（37.06%）、C（11.82%）、G（14.95%）。15个蛋白质编码基因均采用典型的ATG作为起始密码子、TAA或TAG作为终止密码子，基因排列顺序与已报道的青霉属物种相似，在进化上较为保守。蛋白质编码基因编码频率较高的氨基酸分别为Leu、Ile、Ser和Phe；RSCU频率最高的4个密码子依次是UUA、AUA、UUU和GGU。24个tRNA基因存在30处G-U错配，均可形成典型三叶草结构。系统发育分析结果表明，桔青霉分类地位上关系最密切是Penicillium ShG4C，其次是 Penicillium polonicum与Penicillium nordicum。