甘蔗线条花叶病毒HC-Pro基因的分子变异分析

• 作者: 张志想 李世访 李文凤 贺振
• 来源期刊: 植物保护
• 学科: 农学
• 关键词: 甘蔗线条花叶病毒 HC-Pro基因 分子变异
• 年，卷（期）: 2017,（2）
• 所属期刊栏目: 研究报告
• 页码范围: 29-36
• 页数: 8页
• 分类号: S435.661
• 字数: 4415字
• 语种: 中文
• DOI: 10.3969/j.issn.0529-1542.2017.02.005

摘要

为了解析甘蔗线条花叶病毒Sugarcane streak mosaic virus (SCSMV)不同分离物HC-Pro基因的分子变异规律,本研究利用RT-PCR法扩增获得SCSMV HC-Pro基因的序列,通过生物信息学分析,分别从重组、系统发生、选择压力等方面研究SCSMV HC-Pro基因的分子变异特征.共测定了44条SCSMV HC-Pro基因序列,相似性最低值为70％;HC-Pro基因重组频率较低,仅发现3个重组位点,其中一个系首次报道;与先前报道相比,部分新测定云南蔗区的SCSMV分离物在HC-Pro基因上形成一个新组—第Ⅲ组;HC-Pro基因处于很强的负选择压力作用,未发现正向选择作用位点.本研究结果进一步证明SCSMV HC-Pro基因具有高度的遗传多样性.