番茄泛素活化酶基因家族进化及表达模式分析

• 作者: 贾利强 赵秋芳 陈宏良 陈曙 马海洋
• 来源期刊: 热带作物学报
• 学科: 农学
• 关键词: 番茄 泛素活化酶基因 进化分析 基因表达
• 年，卷（期）: 2017,（6）
• 所属期刊栏目: 生物技术,组织培养
• 页码范围: 1081-1087
• 页数: 7页
• 分类号: S641.2
• 字数: 4962字
• 语种: 中文
• DOI: 10.3969/j.issn.1000-2561.2017.06.016

摘要

泛素活化酶是蛋白泛素化所需的第一个酶,在泛素蛋白酶体途径中发挥重要作用.本文利用生物信息学方法从番茄基因组中鉴定出2个泛素活化酶(ubiquitin activating enzyme,UBA)基因,命名为SlUBA 1和SlUBA2.序列分析表明SlUBA1和SlUBA2基因的CDS序列长分别为3 060和3 255 bp,分别编码1 019和1 084个氨基酸,编码蛋白分子量为114.15和120.46 ku,分别位于第6和9染色体.2个基因均含有5个内含子,编码蛋白均为酸性、疏水性蛋白;对蛋白二级结构分析发现2个UBA蛋白均以α--螺旋和无规则卷曲为主;亚细胞定位预测均定位于细胞核.序列比对和进化树分析表明番茄UBA基因与其他物种UBA基因相似性高,进化过程非常保守.番茄不同组织表达分析结果表明2个UBA基因在根系和花的表达量较高,果实成熟过程中的表达量相对较低.非生物胁迫试验结果表明:SlUBA1基因在低温、干旱和盐胁迫下均上调表达;而SlUBA2基因对非生物胁迫没有明显响应,这些结果表明SlUBA 1基因可能参与番茄对低温、干旱和盐胁迫的响应.