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甘薯细胞壁蔗糖转化酶基因IbCWIN家族成员鉴定及表达分析
甘薯细胞壁蔗糖转化酶基因IbCWIN家族成员鉴定及表达分析
作者:
宋天晓
刘意
饶莉萍
Soviguidi Deka Reine Judesse
朱国鹏
杨新笋
原文服务方:
作物学报
甘薯
细胞壁蔗糖转化酶
基因家族
基因表达
摘要:
甘薯是重要的粮食、饲料、工业原料作物和新型的生物能源作物, 细胞壁蔗糖转化酶是植物源、库组织蔗糖代谢的关键酶, 但关于甘薯细胞壁蔗糖转化酶基因IbCWIN家族成员的研究尚未见报道。本研究测定供试品种不同组织部位的蔗糖淀粉含量, 利用生物信息学方法对IbCWIN基因家族的理化性质、保守结构域、系统进化关系、启动子作用元件、组织特异性表达模式进行分析。结果表明, 甘薯茎中蔗糖含量最高, 须根和叶次之, 块根最低; 块根淀粉含量最高, 极显著高于其他部位。甘薯中含有10个IbCWIN基因, 编码氨基酸442~1115个, 蛋白质分子量范围49.56~124.44 kD, 等电点为5.0~9.1。分布在8条染色体上, 都含有Glyco_32保守结构域及相同或相似的保守基序motif, 属于糖基水解酶基因家族GH32。IbCWIN与木薯MeCWINV同源性高, IbCWIN基因家族启动子区域含有多种类型的顺式作用元件。qRT-PCR结果表明, IbCWIN基因家族在甘薯不同组织中均有表达且有多种表达模式, 其中IbCWIN2和IbCWIN9在块根中表达量显著高于其他组织部位。本研究为下一步探索甘薯IbCWIN基因家族的功能及调控甘薯源、库关系机制提供理论指导。
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文献信息
篇名
甘薯细胞壁蔗糖转化酶基因IbCWIN家族成员鉴定及表达分析
来源期刊
作物学报
学科
关键词
甘薯
细胞壁蔗糖转化酶
基因家族
基因表达
年,卷(期)
2021,(7)
所属期刊栏目
作物遗传育种·种质资源·分子遗传学
研究方向
页码范围
1297-1308
页数
11页
分类号
字数
语种
中文
DOI
10.3724/SP.J.1006.2021.04180
五维指标
传播情况
被引次数趋势
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版权信息
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引文网络
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2021(0)
参考文献(0)
二级参考文献(0)
引证文献(0)
二级引证文献(0)
研究主题发展历程
节点文献
甘薯
细胞壁蔗糖转化酶
基因家族
基因表达
研究起点
研究来源
研究分支
研究去脉
引文网络交叉学科
相关学者/机构
期刊影响力
作物学报
主办单位:
中国作物学会
出版周期:
月刊
ISSN:
0496-3490
CN:
11-1809/S
开本:
大16开
出版地:
邮发代号:
创刊时间:
1950-01-01
语种:
chi
出版文献量(篇)
5614
总下载数(次)
0
总被引数(次)
197718
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