甜瓜海藻糖-6-磷酸合成酶基因鉴定及表达

• 作者: 张显 张海斐 杨小振 杨永超 王中元 魏春华
• 来源期刊: 西北植物学报
• 学科: 农学
• 关键词: 甜瓜 海藻糖-6-磷酸合成酶 基因家族 表达分析
• 年，卷（期）: 2017,（6）
• 所属期刊栏目: 研究报告
• 页码范围: 1066-1072
• 页数: 7页
• 分类号: Q786|S652
• 字数: 4339字
• 语种: 中文
• DOI: 10.7606/j.issn.1000-4025.2017.06.1066

摘要

为了明确甜瓜海藻糖-6-磷酸合成酶基因(CmTPS)家族信息及对逆境信号的响应,该研究采用生物信息学方法,通过拟南芥TPS家族基因与甜瓜基因组数据库比对,从甜瓜基因组中共鉴定出7个海藻糖-6-磷酸合成酶基因,按照其在染色体上的位置分别命名为CmTPS1~7.系统进化分析结果显示,CmTPS4和CmTPS7为第1类,二者均含有16个内含子,推测其编码产物均具有海藻糖-6-磷酸合成酶(TPS)活性;其余5个CmTPS基因归为第2类,分别含有2~4个内含子;在这7个甜瓜TPS中,除CmTPS3只有TPS结构域外,其余CmTPS都含有TPS、TPP及UDP-forming结构域;蛋白序列比对结果显示,甜瓜TPS家族各成员间相似性较低(15.90%~57.31%);亚细胞定位预测表明,CmTPS1、CmTPS2和CmTPS6定位在细胞核内,其余4个CmTPS定位在细胞质内.qRT-PCR表达分析表明,低温胁迫下甜瓜叶片可能以CmTPS4为主要的TPS编码基因;CmTPS基因家族对盐胁迫较为敏感,同时在ABA信号传递中起调控作用.这为进一步研究甜瓜TPS基因家族奠定了基础.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	张显	西北农林科技大学园艺学院	151	1219	18.0	28.0
2	杨小振	西北农林科技大学园艺学院	8	190	5.0	8.0
3	杨永超	西北农林科技大学园艺学院	8	12	2.0	3.0
5	魏春华	西北农林科技大学园艺学院	14	27	3.0	5.0
8	张海斐	西北农林科技大学园艺学院	1	6	1.0	1.0
9	王中元	西北农林科技大学园艺学院	2	6	1.0	2.0