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细粒棘球绦虫EgM123基因序列分析及EgM家族基因在虫体不同发育阶段的差异表达分析
细粒棘球绦虫EgM123基因序列分析及EgM家族基因在虫体不同发育阶段的差异表达分析
作者:
毛丽萍
王伟
王正荣
甘尚权
简子健
翟少华
魏玉圆
基本信息来源于合作网站,原文需代理用户跳转至来源网站获取
细粒棘球绦虫
EgM123蛋白
抗原基因
生物信息学
摘要:
对细粒棘球绦虫EgM123基因进行分子克隆和生物信息学分析,同时对EgM家族基因在虫体不同发育阶段的mRNA转录水平进行初步研究.采集绵羊肝脏包囊中原头蚴,提取总RNA,通过RT-PCR获取EgM123纯化的PCR产物,克隆到pGEM-T载体并测序,对测序结果进行结构和功能的预测分析.以Actin基因为内参基因,采用SYBR Green real-time RT-PCR技术,对不同发育阶段,即其原头蚴和成虫的EgM4、EgM9、EgM123的表达量进行检测.结果表明,EgM123基因ORF为594 bp,编码197个氨基酸,蛋白分子质量为21.959 ku,等电点为7.94.EgM123蛋白无信号肽、跨膜螺旋区和卷曲螺旋结构,是一种亲水性的可溶性蛋白质,存在23个磷酸化位点.根据亚细胞定位预测显示,EgM123蛋白主要位于细胞核内.二级结构预测含盯螺旋9.64%、伊折叠22.84%、无规则卷曲62.94%.EgM123氨基酸序列中有6个潜在的抗原表位.RT-qPCR结果显示,成虫阶段EgM家族基因表达量极显著高于原头蚴阶段.在发育的同一阶段,EgM123基因极显著高于EgM4、EgM9基因的表达量.通过EgM家族基因在虫体不同发育阶段的mRNA转录水平,EgM123基因在虫体成虫阶段高表达,以期为筛选细粒棘球绦虫终末宿主疫苗候选基因提供理论依据.
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文献信息
篇名
细粒棘球绦虫EgM123基因序列分析及EgM家族基因在虫体不同发育阶段的差异表达分析
来源期刊
动物医学进展
学科
农学
关键词
细粒棘球绦虫
EgM123蛋白
抗原基因
生物信息学
年,卷(期)
2017,(10)
所属期刊栏目
研究论文
研究方向
页码范围
20-26
页数
7页
分类号
S852.734|Q789
字数
4553字
语种
中文
DOI
10.3969/j.issn.1007-5038.2017.10.004
五维指标
作者信息
序号
姓名
单位
发文数
被引次数
H指数
G指数
1
简子健
新疆农业大学动物医学学院
77
476
10.0
18.0
2
王伟
新疆农业大学动物医学学院
61
329
10.0
15.0
3
翟少华
新疆农业大学动物医学学院
50
71
4.0
5.0
4
毛丽萍
新疆农业大学动物医学学院
9
10
2.0
2.0
5
魏玉圆
新疆农业大学动物医学学院
3
4
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传播情况
被引次数趋势
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引文网络
引文网络
二级参考文献
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共引文献
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参考文献
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节点文献
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同被引文献
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引证文献(0)
二级引证文献(2)
研究主题发展历程
节点文献
细粒棘球绦虫
EgM123蛋白
抗原基因
生物信息学
研究起点
研究来源
研究分支
研究去脉
引文网络交叉学科
相关学者/机构
期刊影响力
动物医学进展
主办单位:
西北农林科技大学
出版周期:
月刊
ISSN:
1007-5038
CN:
61-1306/S
开本:
大16开
出版地:
陕西杨陵西北农林科技大学动物医学院
邮发代号:
52-60
创刊时间:
1980
语种:
chi
出版文献量(篇)
7631
总下载数(次)
22
总被引数(次)
56446
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动物医学进展2017年第2期
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