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摘要:
对细粒棘球绦虫EgM123基因进行分子克隆和生物信息学分析,同时对EgM家族基因在虫体不同发育阶段的mRNA转录水平进行初步研究.采集绵羊肝脏包囊中原头蚴,提取总RNA,通过RT-PCR获取EgM123纯化的PCR产物,克隆到pGEM-T载体并测序,对测序结果进行结构和功能的预测分析.以Actin基因为内参基因,采用SYBR Green real-time RT-PCR技术,对不同发育阶段,即其原头蚴和成虫的EgM4、EgM9、EgM123的表达量进行检测.结果表明,EgM123基因ORF为594 bp,编码197个氨基酸,蛋白分子质量为21.959 ku,等电点为7.94.EgM123蛋白无信号肽、跨膜螺旋区和卷曲螺旋结构,是一种亲水性的可溶性蛋白质,存在23个磷酸化位点.根据亚细胞定位预测显示,EgM123蛋白主要位于细胞核内.二级结构预测含盯螺旋9.64%、伊折叠22.84%、无规则卷曲62.94%.EgM123氨基酸序列中有6个潜在的抗原表位.RT-qPCR结果显示,成虫阶段EgM家族基因表达量极显著高于原头蚴阶段.在发育的同一阶段,EgM123基因极显著高于EgM4、EgM9基因的表达量.通过EgM家族基因在虫体不同发育阶段的mRNA转录水平,EgM123基因在虫体成虫阶段高表达,以期为筛选细粒棘球绦虫终末宿主疫苗候选基因提供理论依据.
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文献信息
篇名 细粒棘球绦虫EgM123基因序列分析及EgM家族基因在虫体不同发育阶段的差异表达分析
来源期刊 动物医学进展 学科 农学
关键词 细粒棘球绦虫 EgM123蛋白 抗原基因 生物信息学
年,卷(期) 2017,(10) 所属期刊栏目 研究论文
研究方向 页码范围 20-26
页数 7页 分类号 S852.734|Q789
字数 4553字 语种 中文
DOI 10.3969/j.issn.1007-5038.2017.10.004
五维指标
作者信息
序号 姓名 单位 发文数 被引次数 H指数 G指数
1 简子健 新疆农业大学动物医学学院 77 476 10.0 18.0
2 王伟 新疆农业大学动物医学学院 61 329 10.0 15.0
3 翟少华 新疆农业大学动物医学学院 50 71 4.0 5.0
4 毛丽萍 新疆农业大学动物医学学院 9 10 2.0 2.0
5 魏玉圆 新疆农业大学动物医学学院 3 4 1.0 1.0
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细粒棘球绦虫
EgM123蛋白
抗原基因
生物信息学
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研究来源
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期刊影响力
动物医学进展
月刊
1007-5038
61-1306/S
大16开
陕西杨陵西北农林科技大学动物医学院
52-60
1980
chi
出版文献量(篇)
7631
总下载数(次)
22
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56446
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