牦牛CCND2基因的克隆及其在不同发情时期卵巢中的表达

• 作者: 兰道亮 李键 熊显荣 石仙 胡嘉嘉 蔡雯祎 陈伟明
• 来源期刊: 中国农业科学
• 关键词: 牦牛 CCND2 克隆 发情周期 卵巢 表达
• 年，卷（期）: 2017,（13）
• 所属期刊栏目: 畜牧·兽医·资源昆虫
• 页码范围: 2604-2613
• 页数: 10页
• 语种: 中文
• DOI: 10.3864/j.issn.0578-1752.2017.13.018

摘要

[目的]研究牦牛细胞周期蛋白D2 (Cyclin D2,CCND2)基因序列特征及其在牦牛不同发情时期卵巢中的表达.[方法]以牦牛为研究对象,提取卵巢的总RNA进行反转录为第一链eDNA,根据GenBank中黄牛CCND2的mRNA序列(GenBank登录号:NM_001076372.1),使用Primer 5.0软件设计引物.应用PCR方法对CCND2基因扩增克隆,并测序获得CCND2基因完整的CDS区序列及部分5'端和3'端UTR区.使用Protparam、SOPMA、SWISS-MODEL及SMART分别对牦牛CCND2蛋白的理化性质、二级结构、三级结构及结构域进行预测分析,并进行同源性分析和系统进化树构建,利用半定量PCR方法对CCND2基因在牦牛各组织中的表达进行检测;同时采用实时荧光定量PCR技术分析CCND2基因在牦牛不同发情时期(卵泡期、红体期、黄体期)卵巢中的相对表达量.[结果]克隆获得牦牛CCND2基因序列为909 bp,其中包含可编码289个氨基酸残基的长为870 bp的CDS区.与黄牛相比,牦牛CCND2的CDS区存在5个碱基突变,导致其中一个氨基酸改变.牦牛CCND2基因CDs序列与野牦牛、黄牛、印度水牛、绵羊、野猪、马、家犬、猫、人类的进行比对同源性分别是99.54％、99.31％、99.31％、98.16％、94.81％、90.46％、90.80％、91.49％、88.62％,物种之间同源性较高,与进化树分析显示的亲缘关系远近一致,表明CCND2基因编码区在进化中较为保守.对CCND2蛋白预测分析知牦牛CCND2基因编码蛋白的分子式为C1445H22315N3770440S18,相对分子质量约为32.59kD,理论等电点为4.75,总平均亲水性为-0.107,不稳定指数为44.56,属亲水不稳定的酸性蛋白,该蛋白无跨膜区和信号肽;二级结构主要包含α-螺旋和无规卷曲,且与三级结构分析结果一致.蛋白含位于第26-152位氨基酸处的Cyclin_N和位于第154-257位氨基酸处的Cyclin_C两个结构域.CCND2基因在牦牛各组织中均有表达,其中在胃、卵巢和脑中表达相对较高;qRT-PCR结果显示在牦牛不同发情时期卵巢中CCND2 mRNA均有表达,且卵泡期卵巢中的表达水平最高(P＜0.01),在红体期和黄体期卵巢中表达水平无差异(P＞ 0.05).[结论]成功获得了牦牛CCND2基因的CDS区全长序列和组织表达谱,对其进行生物信息分析及蛋白功能结构分析为该基因在牦牛繁殖调控中的进一步研究提供理论依据;在牦牛不同发情时期卵巢中CCND2mRNA表达水平存在差异,可能与卵泡发育过程中颗粒细胞增殖分化、卵泡发生波及卵巢内分泌有关,为进一步研究牦牛卵巢发育机制及改善牦牛繁殖效率提供了基础资料.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	李键	西南民族大学生命科学与技术学院	117	464	10.0	15.0
2	兰道亮	西南民族大学青藏高原研究院	46	196	7.0	10.0
3	熊显荣	西南民族大学生命科学与技术学院	39	109	6.0	7.0
4	陈伟明	西南民族大学生命科学与技术学院	5	11	2.0	3.0
5	石仙	西南民族大学生命科学与技术学院	6	11	2.0	3.0
6	蔡雯祎	西南民族大学生命科学与技术学院	7	14	3.0	3.0
7	胡嘉嘉	西南民族大学生命科学与技术学院	6	12	2.0	3.0