牦牛与黄牛肌肉差异蛋白质组及生物信息学分析

• 作者: 余群力 孔祥颖 左惠心 牛克兰 赵索南 韩玲
• 来源期刊: 农业机械学报
• 学科: 工学
• 关键词: 牦牛 黄牛 肌肉组织 双向电泳 差异蛋白质组学 生物信息学
• 年，卷（期）: 2017,（4）
• 所属期刊栏目: 农产品加工工程
• 页码范围: 313-320
• 页数: 8页
• 分类号: TS207.3
• 字数: 6362字
• 语种: 中文
• DOI: 10.6041/j.issn.1000-1298.2017.04.041

摘要

为了建立和优化牦牛肌肉组织蛋白质双向电泳(2DE)体系,结合生物信息学方法进行牦牛、黄牛差异蛋白质通路分析.以牦牛背最长肌为实验材料,对不同裂解液成分、等电聚焦程序、染色方法进行研究,在最优2DE体系参数下,对比分析牦牛、黄牛差异倍数大于2倍且达到显著水平(P＜0.05)的19个蛋白质,通过基质辅助激光解吸/电离飞行时间(MALDI-TOF/TOF)质谱进行鉴定,并对鉴定结果进行了基因本体(GO)注释、京都基因与基因组百科全书(KEGG)通路分析.结果表明,裂解液Ⅱ、渐进式快速升压程序、改良的考染法获得的蛋白点匹配率高,牦牛、黄牛2DE图谱蛋白点平均个数分别为479个和553个.通过比较牦牛和黄牛背最长肌中差异蛋白质可知,所得到的差异蛋白质按照功能可分为代谢酶、结构蛋白和应激蛋白3大类.通过KEGG分析可知,牦牛、黄牛差异蛋白质主要集中在细胞代谢过程、碳水化合物代谢通路、遗传信息通路和能量代谢通路中,研究结果可为解释牦牛和黄牛肌肉生物学特性和肉品质差异提供理论依据.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	余群力	甘肃农业大学食品科学与工程学院	220	1568	21.0	29.0
2	韩玲	甘肃农业大学食品科学与工程学院	147	1133	18.0	26.0
3	孔祥颖		3	9	2.0	3.0
4	左惠心	甘肃农业大学食品科学与工程学院	5	25	4.0	5.0
5	牛克兰	甘肃农业大学食品科学与工程学院	3	16	3.0	3.0
6	赵索南		5	10	2.0	3.0