肾脏纤维化大鼠模型尿液中差异表达基因筛选及生物信息学分析

• 作者: 刘彦信 史娟 孙佳增 张尚 石变华 郑德先
• 来源期刊: 基础医学与临床
• 学科: 医学
• 关键词: 肾脏纤维化 生物信息学分析 转录组测序 单侧输尿管结扎
• 年，卷（期）: 2017,（4）
• 所属期刊栏目: 研究论文
• 页码范围: 500-505
• 页数: 6页
• 分类号: R34
• 字数: 2524字
• 语种: 中文

摘要

目的研究大鼠肾脏纤维化(RF)模型尿液中差异表达的基因,并对其进行生物信息学分析.方法将大鼠分为对照组和纤维化模型组,单侧输尿管结扎术建立大鼠肾脏纤维化模型,收集尿液.提取总RNA,构建测序文库并进行转录组测序.对差异表达的mRNA进行了GO分析和KEGG分析,并对miRNA的前体和lncRNA的家族进行预测和分类.结果肾脏纤维化模型组的尿液和对照组相比,得到813条表达上调转录本数据以及213条表达下调的转录本数据.结论利用转录组高通量测序结合相关生物信息学分析,可为肾脏纤维化诊断靶点提供新的可能.