ITS2二级结构系统发育信息在茄属药用植物DNA条形码鉴定中的应用价值

• 作者: 张伟 李美慧 杨烁 薛渊元 赵奉熙 赵宏
• 来源期刊: 中国中药杂志
• 关键词: DNA条形码 ITS2二级结构 药用植物 茄属
• 年，卷（期）: 2017,（3）
• 所属期刊栏目: 分子生药学
• 页码范围: 456-464
• 页数: 9页
• 语种: 中文

摘要

ITS2是中药鉴定的核心DNA条形码之一,基于ITS2的中药鉴定方法已被纳入《中国药典》,但分辨力不足仍是制约其推广应用的主要因素,因此需要进一步挖掘其有助于中药鉴定的遗传信息.在细胞内,ITS2以二级结构形式发挥功能,这种结构所蕴含的丰富遗传信息是核酸序列所无法体现的.该研究以茄属Solanum 26个物种的40个样本为研究对象来探究ITS2二级结构在茄属药用植物鉴定中的价值.作者利用PicXAA-R,MASTR和LocARNA软件来比对二级结构,利用RNAstat软件将二级结构信息转为系统发育信息,最后利用最大简约法进行建树分析.研究结果表明将ITS2二级结构转化为系统发育信息后信息位点增加了88.57%,物种关系树上50%,75%,90%以上支持率的支系分别增加了19.05%,66.67%,66.67%,从而很好地解决了茄属几种药用植物的鉴定问题.鉴于以上结果,作者建议将ITS2二级结构信息作为系统发育信息的有益补充加入到目前DNA条形码分析中.