基于DNA条形码的甘草属植物的分子鉴别

• 作者: 尚兴朴 李珍珍 王继永 赵润怀 邓庭伟 郑司浩
• 来源期刊: 中国现代中药
• 学科: 农学
• 关键词: 甘草属 DNA条形码 分子鉴别 内转录间隔区
• 年，卷（期）: 2020,（2）
• 所属期刊栏目: 基础研究
• 页码范围: 207-212,218
• 页数: 7页
• 分类号: R282|S567.71
• 字数: 3369字
• 语种: 中文
• DOI: 10.13313/j.issn.1673-4890.20181124002

摘要

目的:评价不同DNA条形码序列对甘草属的鉴定能力.方法:应用5条常用DNA条形码序列ITS、ITS2、psbA-trnH、matK与rbcL对甘草属进行PCR扩增与序列测序,结合在GenBank数据库下载的序列数据,通过分析各序列种内与种间变异与遗传距离,构建系统发育树,并基于相似性搜索算法和最近距离法计算各序列鉴定成功率,以分析比较各序列对甘草属的鉴定效率.结果:matk序列因扩增与测序成功率均较低,没有加入后续的数据分析.各个序列的鉴定成功率由高到低的顺序为psb A-trnH、ITS、ITS2、rbcL.ITS和ITS2序列种间最小变异均大于种内最大变异,且种内变异最小.Barcoding gap检验结果显示,ITS、ITS2的重叠区较小.NJ树结果显示,只有psbA-trnH序列能把甘草属不同物种分开.结论:利用DNA条形码序列可准确鉴别甘草属植物,psbA-trnH和ITS组合序列可作为鉴定甘草属植物的较优序列组合.本研究为甘草属植物的分子鉴别提供科学依据.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	王继永		34	110	7.0	9.0
2	赵润怀		8	48	4.0	6.0
3	尚兴朴		12	9	2.0	3.0
4	邓庭伟		8	13	2.0	3.0
5	李珍珍		2	2	1.0	1.0
9	郑司浩		7	5	2.0	2.0