高通量测序分析miRNAs在胃癌新鲜组织与石蜡包埋组织中的表达

• 作者: 唐丹 曾文泓 王丽华
• 来源期刊: 重庆医学
• 学科: 医学
• 关键词: 胃肿瘤 miRNA 甲醛固定石蜡包埋 二代测序
• 年，卷（期）: 2017,（32）
• 所属期刊栏目: 技术与方法
• 页码范围: 4550-4552
• 页数: 3页
• 分类号: R35
• 字数: 2709字
• 语种: 中文
• DOI: 10.3969/j.issn.1671-8348.2017.32.025

摘要

目的 利用二代测序技术对FFPE标本进行高通量测序及相关的生物信息学分析,探讨miRNAs在来源于石蜡包埋胃癌组织(FFPE)中的标本检测的可靠性,探讨其临床意义.方法 选取2015年和2016年2例胃癌患者手术切除同一组织的FFPE和新鲜冰冻标本,从标本中提取RNA并分离构建small RNA文库,采用Illumina测序平台测序的方法对其进行高通量测序,统计各已知miRNAs家族序列的表达量,构建已知miRNAs表达谱,对标本miRNAs进行Spearman相关性分析,评估miR-NAs表达量的差异变化情况.结果 新鲜冰冻标本中提取的总RNA质量较高,RNA保存度完整,显示28S是18S的1.3～1.4倍,从石蜡组中提取的RNA,结果显示有不同程度的降解,28S和18S的波峰不明显,miRNAs表达谱在冰冻和FFPE标本中,Spearman相关系数分别为0.90争0.86,两者miRNAs表达量较一致,具有相关性.结论 FFPE中的miRNAs仍然保持一定的完整性,且可通过二代测序进行肿瘤标本检测.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	王丽华	江西中医药大学附属医院骨四科	76	310	10.0	15.0
2	曾文泓	江西中医药大学基础医学院	15	21	3.0	3.0
3	唐丹	南昌大学第一附属医院老干科	4	10	2.0	3.0