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基于特征挖掘的基因组缺失变异集成检测方法
基于特征挖掘的基因组缺失变异集成检测方法
作者:
凌诚
张晓东
高敬阳
基本信息来源于合作网站,原文需代理用户跳转至来源网站获取
缺失变异
特征挖掘
集成检测
摘要:
随着高通量测序技术的应用与发展,基于测序的缺失变异检测方法大量涌现.然而,单一检测方法仍存在适用的局限性以及检测精度与敏感度不足的问题.为此,提出一种基于多检测理论融合的特征挖掘与机器学习算法集成的基因组缺失变异综合检测方法.该方法将多种工具应用于个体缺失变异检测,得到变异检测初始集;再根据多种检测理论对初始集中的缺失变异进行序列特征挖掘与特征提取;最后,将检测工具与机器学习算法相融合以获得集成的检测方法,剔除初始集中的假阳性变异,获得最终的结果集.基于千人基因组计划数据的实验表明,相较于单个工具的检测结果,该方法在检测精度和敏感度上均占优势;相较于多个工具检测结果的直接组合,该方法在损失少许检测敏感度的前提下显著地提高了检测精度.
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文献信息
篇名
基于特征挖掘的基因组缺失变异集成检测方法
来源期刊
计算机科学
学科
工学
关键词
缺失变异
特征挖掘
集成检测
年,卷(期)
2017,(1)
所属期刊栏目
2016第六届中国数据挖掘会议
研究方向
页码范围
80-83
页数
4页
分类号
TP391|Q523
字数
3674字
语种
中文
DOI
10.11896/j.issn.1002-137X.2017.01.015
五维指标
作者信息
序号
姓名
单位
发文数
被引次数
H指数
G指数
1
高敬阳
北京化工大学信息科学与技术学院
26
147
7.0
11.0
2
张晓东
北京化工大学信息科学与技术学院
11
33
3.0
5.0
3
凌诚
北京化工大学信息科学与技术学院
2
0
0.0
0.0
传播情况
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引文网络
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引证文献(0)
二级引证文献(0)
研究主题发展历程
节点文献
缺失变异
特征挖掘
集成检测
研究起点
研究来源
研究分支
研究去脉
引文网络交叉学科
相关学者/机构
期刊影响力
计算机科学
主办单位:
重庆西南信息有限公司(原科技部西南信息中心)
出版周期:
月刊
ISSN:
1002-137X
CN:
50-1075/TP
开本:
大16开
出版地:
重庆市渝北区洪湖西路18号
邮发代号:
78-68
创刊时间:
1974
语种:
chi
出版文献量(篇)
18527
总下载数(次)
68
总被引数(次)
150664
相关基金
国家自然科学基金
英文译名:
the National Natural Science Foundation of China
官方网址:
http://www.nsfc.gov.cn/
项目类型:
青年科学基金项目(面上项目)
学科类型:
数理科学
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