基于重测序的大豆新品种齐黄34的全基因组变异挖掘

• 作者: 张彦威 张礼凤 徐冉 戴海英 李伟 王彩洁
• 来源期刊: 中国油料作物学报
• 学科: 农学
• 关键词: 全基因组重测序 单核苷酸多态 小片段插入缺失 结构变异 基因变异
• 年，卷（期）: 2016,（2）
• 所属期刊栏目: 生物技术
• 页码范围: 150-158
• 页数: 9页
• 分类号: S565.103
• 字数: 4859字
• 语种: 中文
• DOI: 10.7505/j.issn.1007-9084.2016.02.003

摘要

为全面揭示大豆优良品种和重要亲本的全基因组突变类型,采用高通量重测序技术,对大豆品种齐黄34进行全基因组重测序,测序深度13×,共检测到1 519 494个单核苷酸多态位点,357 549个小片段插入缺失位点,4 506个结构变异;这些变异共导致了17 748基因变异;大量光周期相关的重要基因发生突变,其中包括CRYP-TOCHROME 2、GIGANTEA、Timing of CAB expression 1、E1、PHYTOCHROME A、Flowering Locus T、CONSTANS、Terminal Flower like等,齐黄34为E1基因型.本研究为分子标记辅助选择提供了重要的标记资源.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	徐冉	山东省农业科学院作物研究所	91	757	15.0	25.0
2	王彩洁	山东省农业科学院作物研究所	64	674	14.0	24.0
3	戴海英	山东省农业科学院作物研究所	37	344	10.0	17.0
4	张礼凤	山东省农业科学院作物研究所	55	651	14.0	24.0
5	李伟	山东省农业科学院作物研究所	48	520	13.0	21.0
6	张彦威	山东省农业科学院作物研究所	21	72	5.0	8.0