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不结球白菜花青苷合成负调控基因BrcLBD39的克隆和表达分析及其对外源6-BA的响应
不结球白菜花青苷合成负调控基因BrcLBD39的克隆和表达分析及其对外源6-BA的响应
作者:
侯喜林
张志硕
胡春梅
董慧杰
韩克
基本信息来源于合作网站,原文需代理用户跳转至来源网站获取
不结球白菜
LBD39
同源克隆
序列分析
基因表达
摘要:
[目的]本文旨在探究LBD39基因在不结球白菜紫色和绿色材料中的特性及其对外源6-BA的响应,为花青苷调控机制奠定理论基础.[方法]以不结球白菜紫色自交系 NJZX1-3及其绿色突变体 NJZX1-0为材料,同源克隆LBD39基因的全长,应用生物信息学方法分析其核酸和蛋白序列及其进化关系,并在线预测蛋白质二级和三级结构.采用外源6-BA处理后测定叶片中花青苷含量,并通过实时荧光定量PCR技术测定了LBD39基因在外源6-BA处理后的表达水平.[结果]在2个不同材料中克隆获得的LBD39基因完全相同,序列长为876 bp,包含编码区(长为699 bp)及非编码区(长为177 bp).其编码区序列含有1个长为696 bp 的开放阅读框(ORF),编码232个氨基酸,将该基因命名为BrcLBD39.亚细胞定位预测该蛋白分布在细胞核中,蛋白相对分子质量为25.30×103,等电点为8.85.进化树分析表明,BrcLBD39蛋白序列与大白菜BraLBD39相似性为100%,其次与油菜和甘蓝关系最近,相似性分别为99%和93%.外源6-BA处理24 h以后紫色材料NJZX1-3叶片中花青苷含量均高于对照,而绿色突变体叶片基本不含花青苷;BrcLBD39基因在2个材料中具有相似的表达模式,即先下降后上升而后又下降,其中在处理后48 h时BrcLBD39基因表达量急剧增加,在紫色和绿色材料中增量分别为74.84%和49.87%.此外,BrcLBD39表达量在绿色材料中明显高于紫色材料.[结论]不结球白菜中花青苷负调控基因BrcLBD39既响应外源6-BA,又与叶片中花青苷的积累密切相关,在花青苷的生物合成过程中起着重要的调控作用.
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文献信息
篇名
不结球白菜花青苷合成负调控基因BrcLBD39的克隆和表达分析及其对外源6-BA的响应
来源期刊
南京农业大学学报
学科
农学
关键词
不结球白菜
LBD39
同源克隆
序列分析
基因表达
年,卷(期)
2018,(1)
所属期刊栏目
植物科学
研究方向
页码范围
49-56
页数
8页
分类号
S634.3
字数
5561字
语种
中文
DOI
10.7685/jnau.201704035
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不结球白菜
LBD39
同源克隆
序列分析
基因表达
研究起点
研究来源
研究分支
研究去脉
引文网络交叉学科
相关学者/机构
期刊影响力
南京农业大学学报
主办单位:
南京农业大学
出版周期:
双月刊
ISSN:
1000-2030
CN:
32-1148/S
开本:
大16开
出版地:
南京市卫岗1号
邮发代号:
28-53
创刊时间:
1956
语种:
chi
出版文献量(篇)
2940
总下载数(次)
5
总被引数(次)
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