沙门氏菌CRISPR位点的结构特征比较

• 作者: 张聪聪 曲道峰 沈杨 韩剑众
• 来源期刊: 微生物学报
• 关键词: 沙门氏菌 CRISPR 间隔区 质粒
• 年，卷（期）: 2018,（2）
• 所属期刊栏目: 研究报告
• 页码范围: 209-218
• 页数: 10页
• 语种: 中文
• DOI: 10.13343/j.cnki.wsxb.20170030

摘要

成簇规律间隔的短回文重复序列(Clustered regularly interspaced short palindromic repeats, CRISPR),是存在于多数细菌和古菌中的遗传结构,能够有效防御外源DNA的入侵(质粒、噬菌体等),进而防御外源基因的水平转移.[目的]本研究以沙门氏菌属中常见的鸡伤寒沙门氏菌(Salmonella gallinarum)、鼠伤寒沙门氏菌(Salmonella typhimurium)、猪霍乱沙门氏菌(Salmonella choleraesuis)以及肠炎沙门氏菌(salmonella enteritidis)等30个菌株为研究对象.探索CRISPR位点在不同沙门氏菌种中的结构差异.[方法]通过生物信息学的方法比较间隔序列与插入序列的同源性以及CRISPR位点与质粒数量关系.[结果]30株沙门氏菌中均存在CRISPR结构,包括CRISPR位点61个以及可疑位点12个.重复序列和cas1基因均不能作为这4类细菌的分类依据.[结论]虽然我们发现CRISPR位点数量与间隔区数量和质粒数量之间均不存在统计学关系,但间隔序列整合子、耐药基因等移动遗传原件具有一定的同源性,说明沙门氏菌在进化过程中不断受外源基因的侵袭.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	韩剑众	浙江工商大学食品与生物工程学院	64	474	12.0	20.0
2	曲道峰	浙江工商大学食品与生物工程学院	25	63	4.0	7.0
3	沈杨	浙江工商大学食品与生物工程学院	1	2	1.0	1.0
4	张聪聪	浙江工商大学食品与生物工程学院	1	2	1.0	1.0