油菜查尔酮异构酶基因的克隆及SNP分析

• 作者: 刘亚萍 刘璐 刘霞 卢虹 徐爱遐 王阳 田正书 黄镇
• 来源期刊: 华北农学报
• 学科: 农学
• 关键词: 油菜 查尔酮异构酶 CHI 克隆 SNP
• 年，卷（期）: 2018,（1）
• 页码范围: 102-108
• 页数: 7页
• 分类号: Q78|S634.03
• 字数: 4319字
• 语种: 中文
• DOI: 10.7668/hbnxb.2018.01.016

摘要

类黄酮是一种重要的植物次生代谢产物,查耳酮异构酶(CHI)是类黄酮生物合成早期阶段的一个关键酶,在种皮发育和颜色形成过程中具有重要的调控作用.为深入研究CHI基因在种皮发育和颜色形成中的作用及生物学功能.以16份三大类型黄、褐籽油菜为试验材料,采用同源克隆法克隆得到CHI基因的序列,并进行分子进化分析.将克隆得到的序列利用NCBI在线软件预测ORF Finder分析该基因的开发阅读框(ORF),结果发现,CHI基因ORF长度为756 bp或759 bp,编码251个或252个氨基酸.利用DNAMAN (v5.0)软件进行序列同源比对分析结果表明,CHI基因在三大类型油菜中的同源率为96.41%;利用NCBI在线软件CDD预测其保守结构域,发现它们都具有查尔酮超家族保守结构域.利用MEGA 5.2软件进行系统进化分析,结果表明,CHI基因在白菜型油菜与甘蓝型油菜中亲缘关系较近,与芥菜型油菜亲缘关系较远,并发现油菜与萝卜、拟南芥的CHI亲缘关系较近.比较三大类型油菜中黄籽油菜与褐籽油菜中CHI基因序列,结果发现,该基因在第202(C/A)位核苷酸处存在差异,可导致第68位氨基酸(P/T)的差异,这可能与油菜种皮的颜色的变化有关.该研究揭示了CHI基因的特征,为阐明CHI基因在油菜种皮颜色形成过程中的作用机制及其功能特征奠定基础.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	刘璐	西北农林科技大学农学院	41	307	10.0	15.0
2	刘亚萍	西北农林科技大学农学院	4	22	2.0	4.0
3	徐爱遐	西北农林科技大学农学院	17	82	5.0	8.0
4	刘霞	西北农林科技大学农学院	22	217	7.0	14.0
5	王阳	西北农林科技大学农学院	33	190	8.0	12.0
6	黄镇	西北农林科技大学农学院	13	50	4.0	6.0
7	卢虹	西北农林科技大学农学院	5	22	3.0	4.0
8	田正书	西北农林科技大学农学院	1	1	1.0	1.0