适用于二代测序技术的细菌DNA提取方法的比较研究

• 作者: 何秋星 刘德星 岳巧云 邱德义 陈佩 陈利伟
• 来源期刊: 检验检疫学刊
• 学科: 医学
• 关键词: 二代测序技术 细菌DNA提取方法 16S r RNA V3-V4高变区
• 年，卷（期）: 2018,（2）
• 页码范围: 55-60
• 页数: 6页
• 分类号: R37

摘要

为建立用于二代测序技术的最适细菌DNA提取方法。分别用磁珠法、热裂解法、试剂盒法（有溶菌酶处理和无溶菌酶处理）、超声波法、超声＋热裂解法共6种方法提取等量混合的细菌DNA,特异性扩增其16S r RNA的V3-V4高变区基因,经二代测序并分析结果中的细菌种类及其相对含量分布。6种方法的测序结果中,细菌种类鉴定结果无明显差异;而在磁珠法和试剂盒法（有溶菌酶处理）结果中,不同细菌的含量分布最为接近样品中的真实情况。在6种方法中,磁珠法和试剂盒法（有溶菌酶处理）适合于二代测序技术中混合细菌DNA的提取。