大豆TST基因的生物信息学及表达模式分析

• 作者: 宋伟 张永艳 徐玲秀 李文滨 王金阳 赵雪 韩英鹏
• 来源期刊: 东北农业大学学报
• 学科: 农学
• 关键词: 大豆 GmTST 生物信息学分析 表达分析
• 年，卷（期）: 2018,（1）
• 所属期刊栏目: 研究报告
• 页码范围: 1-9
• 页数: 9页
• 分类号: S565.1
• 字数: 5040字
• 语种: 中文
• DOI: 10.3969/j.issn.1005-9369.2018.01.001

摘要

TST为典型膜结合蛋白,具有高度保守序列,广泛存在于植物组织和细胞中.文章根据NCBI网站、Phytozomes数据库和MEGA软件分析大豆基因组中TST同源基因生物信息,发现大豆相关数据库中有8个大豆TST相关基因拷贝,其中5个TST基因与拟南芥和甜菜亲缘关系较近;通过实时荧光定量PCR分析大豆TST基因时空表达模式,确定GmTST2.1基因发挥拷贝作用;克隆GmTST2.1基因并分析其生物信息发现,GmTST2.1蛋白质由734个氨基酸组成,PI为5.1不稳定疏水性蛋白质,二级结构主要由α-螺旋、无规则卷曲和片层结构组成,有典型N端跨膜结构域-中间胞质区-C端跨膜区结构域特征.研究分析GmTST基因生物信息学和表达模式,为进一步验证Gm TST基因生物学功能提供借鉴和理论基础.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	韩英鹏	东北农业大学大豆研究所	49	447	13.0	18.0
2	李文滨	东北农业大学大豆研究所	153	1793	22.0	33.0
3	赵雪	东北农业大学大豆研究所	17	50	4.0	6.0
4	宋伟	东北农业大学大豆研究所	4	34	3.0	4.0
5	张永艳	东北农业大学大豆研究所	1	0	0.0	0.0
6	王金阳	东北农业大学大豆研究所	1	0	0.0	0.0
7	徐玲秀	东北农业大学大豆研究所	1	0	0.0	0.0